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二十年前，小兒外科專科實習醫生況叢昕與許甘楓，一同參與醫學院教授鍾懷霜主刀的嶄新手術。病童林美詩因失血過多而喪命，甘楓懷疑手術過程有失誤，叢昕卻拒絕作證，二人因此反目。多年後，叢昕成為安妮醫院的顧問醫生。院長梁鼎君與叢昕亦師亦友，二人希望能共同籌建兒科中心。為了西北醫院病童莫啟健，甘楓前來找叢昕協助進行聯合手術。手術中，麻醉科醫生的失誤險些讓手術無法進行，幸好心胸肺外科副顧問醫生章以芯及時出現。

周振堯接任院長，並挑選麥海琪升任外科主管，叢昕的研究項目也被煞停。西北醫院的肝移植配額被取消，甘楓因此備受同事指責。以芯發現病童翁巧喬罹患心臟惡性血管肉瘤，但巧喬的父母不忍讓她知道真相。叢昕得知甘楓工作不順，建議海琪邀請甘楓加盟安妮醫院。巧喬因未能出院影響合奏練習，與同學鬧翻；以芯認為應讓她知道病情，於是向叢昕與甘楓求助。甘楓指責叢昕刻意炒作啟健換肝事件，導致自己被迫離開西北醫院。

連卓盈、游芝樺等專科實習醫生，以及專科醫生文柏熙，進入兒科病房展開工作。叢昕為病人施行手術，但因出血問題延長。振堯指派海琪接收私症，振堯為免得罪富商，下令動用緊急手術室。此時，病童田思濠傷口破裂急需手術，但緊急手術室已被佔用，柏熙不知所措，甘楓趕來協助，並責罵柏熙不懂靈活變通，令柏熙大受打擊。海琪未能履行承諾，甘楓憤然辭職。巧喬猜出自己身患絕症，並與好友和好。叢昕百感交集，向甘楓與以芯訴說自己的宏願。

甘楓重遇前女友Betsy，其言行引人側目。以芯在叢昕與甘楓協助下，順利為巧喬切除血管肉瘤，以芯希望甘楓留在安妮，甘楓卻開出無理條件。柏熙的能力備受質疑，甘楓給他機會擔任主刀。叢昕繼續完成與鼎君合撰的論文，並獲海琪協助。柏熙與卓盈合作進行膽囊切除手術時發生意外，叢昕的論文獲國際醫學期刊發表，第一作者竟是振堯。Betsy情緒失控，坦言為人父母的壓力與辛酸，以芯深受感觸，隨後突然不適暈倒。

振堯提議與叢昕合作建立兒科中心，叢昕拒絕。患有家族性澱粉樣多發性神經病變的李沛星被送進醫院，叢昕建議同時更換三個器官，但遭振堯反對。海琪向沛星父母說明病情時，叢昕突然向他們提出可進行三重器官移植手術，海琪頗為不滿。甘楓認為叢昕的做法不妥，以芯則覺得甘楓對叢昕抱有偏見。叢昕向倫理評審會提出以研究名義進行三重器官移植手術，遭眾委員反對。此時，沛星病情急轉直下。

以芯、叢昕與甘楓合力完成手術，鍾懷霜到場恭賀眾人，甘楓對她心生敵意。懷霜表示日後可多與叢昕合作，並推薦叢昕加入倫理評審會，令甘楓不滿叢昕靠攏懷霜。陳珮如想把一對子女送到醫院交由甘楓照顧，但甘楓正進行手術中，珮如竟臨時將子女交給以芯。颱風將至，海琪忙於安排應對措施，叢昕想勸她學習放手。甘楓禁不住再次與叢昕爭吵，此時醫院突然停電，少婦羅麗娜抱著半歲女兒睿睿來急診，正逢狂風暴雨。

海琪統籌各項應急措施，振堯竟主動協助。以芯發現睿睿患有嚴重心臟問題，必須進行緊急手術。十號風球下，卓盈的父親連城武到急症室求醫。海琪被玻璃割傷，叢昕為她處理傷口，兩人卻雙雙被困在研究室。護士伍勵寶得知有病童確診肺腫瘤，情況危急。水淹電機房，後備電源損毀，醫院全面大停電，柏熙與芝樺在黑暗中觸診尋找病患。以芯為睿睿施行手術，副手戴日進突然昏倒，甘楓趕來幫忙，但睿睿的心臟仍無法正常運作。

以芯發現甘楓透過交友軟體認識異性，熱心幫他挑選對象。柏熙被一位無禮挑剔的大叔糾纏，後來才得知對方身分。甘楓接收患有罕見病的盧可琳，其母劉依莉曾是叢昕的病人。海琪、以芯、甘楓即興結伴觀星，巧遇叢昕，叢昕決定成立一個手術精英團隊。社工向懷霜商借其往日其夫文志圖為兒童院拍攝的底片，勾起懷霜與柏熙的心結。經診斷，可琳腎臟長出2.5公分腫瘤，依莉哀求甘楓與柏熙改寫報告。

甘楓雖然拒絕依莉的請求，但仍想替可琳爭取資助。社交平台爆出振堯公器私用的醜聞，叢昕、海琪等人看到振堯被媒體追訪的狼狽樣，都大快人心。病童否認未遵守禁食規定，卓盈決定照常進行手術；手術中病童卻出現食物逆流，幸好上司郭葆晶及時出手，病童才得以保命。勵寶為柏熙送上便當，柏熙不為所動。振堯在研討會上力指叢昕安排肺腫瘤病童轉院不妥，叢昕以銳利詞鋒反駁。依莉探望可琳時，依莉的腫瘤突然破裂，需立即進行緊急手術。

甘楓安慰可琳，決心為她爭取資助，卻沒想到本來順利的申請，竟突然遭到阻撓。叢昕與艱難團隊商討外科助手人選，眾人對於選擇柏熙或鄧偉聰意見各異。海琪的丈夫蘇炳良是植物人，炳良的姐姐希望接他回加拿大，海琪雖萬般不捨，卻不敢拒絕。柏熙見卓盈因失誤受罰，對她伸出援手。叢昕要求柏熙與偉聰想出病童誤吞鋼珠的解決方案，偉聰率先猜到柏熙的方法捷足先登，在會議上，振堯阻撓兒科中心的發展，懷霜的言論令形勢大轉。

叢昕接手醫學院轉介的個案，半歲大的蔡思瀚先天腸道閉鎖，手術後病情仍未改善，其主診醫生是振堯的太太林明珠。芝樺接手十六歲女病人徐佳雪，檢查發現佳雪懷孕，卻同時驗出卵巢有腫瘤，佳雪父親為保女兒性命，決定放棄胎兒。電視台到醫院拍攝兒科專題特輯，以芯接受訪問，講述曾在無國界醫生工作的往事。炳良的舊同學Sandra前來探望，海琪直覺她與炳良關係不尋常，向叢昕吐露心事，芝樺忙碌一整天後，突然在梯間昏倒。

卓盈發現芝樺倒臥在梯間，經檢查後確認她需進行緊急手術，柏熙查明思瀚的病因，但明珠不願承認失誤，振堯也力挺妻子，拒絕讓柏熙替思瀚動手術。叢昕以病情危急為由，要求柏熙為思瀚進行緊急手術；振堯在接受採訪途中衝進手術室阻止。手術前夕，佳雪哀求海琪替她保住胎兒，令海琪感到為難，因佳雪的父親已簽署手術同意書。佳雪不想令父親失望，隨即收回請求；手術後，佳雪卻陷入昏迷。

懷霜轉介印度皇室後裔Mike給叢昕，並表示若成功治好他，興建兒科中心的計畫將可順利推進。佳雪的父親最終理解女兒心意，向海琪表達謝意。芝樺思考是否繼續當醫生，向以芯提起小時候曾遇過一位仁義細心的急症室醫生，以芯希望找到這名醫生來鼓勵芝樺。柏熙與一群專科實習生相約宵夜，途中遇上懷霜。甘楓開始追求以芯，但以芯完全未察覺。叢昕以振堯大鬧手術室的短片威脅，要求他同意興建兒科中心；振堯隨後則向叢昕還擊。

芝樺辭去工作，眾人難掩不捨。會議上，振堯提議將空置地皮改建腸胃科中心，叢昕竟沒有反對。醫院為兒科病人舉辦狗醫生活動，Mike與病童白俊彥結為朋友；兩人的病情逐漸惡化，以芯診斷後指出，他們均急需肺部移植。以芯不慎扭傷腳，甘楓見狀十分緊張，更藉機向以芯表白。海琪安排炳良轉院，忍不住在叢昕懷中痛哭。以芯收到通知，將有一對屍肺送到安妮醫院，同時也意味著必須在俊彥與Mike之間作出取捨。

以芯想出一個冒險方法，同時拯救Mike與俊彥，懷霜不願節外生枝，從中阻撓；叢昕無懼得罪懷霜，成功將以芯的計畫推上手術台。芝樺在醫院重遇同儕們，頓感滿心失落與不捨。甘楓鼓勵芝樺，芝樺終於重新振作。海琪發現振堯暗中蒐集她在佳雪手術中違規的證據，得知叢昕為了顧全她而放棄打擊振堯，決定回應叢昕的感情。卓盈迎來惡耗，柏熙無從安慰。Mike與俊彥的手術成功，引起外界關注，此時Mike傷口卻大出血。

艱難團隊大受打擊，振堯直指以芯的失誤導致手術失敗。柏熙等人懷疑病童何小玉罹患蜂窩性組織炎，但也擔憂可能是更嚴重的壞死性筋膜炎，卻無法即時給小玉的母親一個肯定答案。隨後，小玉病情急轉直下，懷霜警告叢昕，他必須在友情與兒科中心之間做出抉擇。甘楓等人翻查以芯執行手術的監視器片段，終於找出手術失敗的原因；甘楓與以芯想找出證據，但證據已被人悄悄取走。海琪擔心其他病人有術後併發症風險，吩咐眾醫生為病人進行緊急檢查。

海琪堅持為病人進行緊急檢查，此舉激怒了振堯。消失的證據竟意外出現在以芯辦公室，為免振堯從中阻撓，以芯等人決定暗中調查。杜霏晨與杜霏雨是一對雙胞胎姊妹，甘楓懷疑霏雨可能罹患罕見遺傳病——威爾遜症，為謹慎起見，霏晨也需接受檢查。以芯推測收到證據的原因，並相約叢昕、甘楓與海琪共進晚餐商討此事，四人離開餐廳時遭遇賊人，證據也被搶走，柏熙得知先前腸扭轉的病人個案原來是懷霜暗中安排，頓感羞辱，與懷霜大吵。

甘楓察覺遇劫事件另有隱情，叢昕明白已無法再隱瞞，以芯對叢昕極度失望，與他決裂。柏熙情緒陷入低谷，手術期間屢次出現手震徵象，興建兒科中心的計劃正式通過，懷霜再次轉介個案給叢昕，但叢昕的私症配額已滿，懷霜企圖以行政手段增加醫生的私症時數。芝樺轉到內科展開專科實習生涯。海琪不願叢昕受懷霜掣肘，藉機向記者澄清安妮醫院增加私症時數只是傳聞。叢昕見海琪公然與懷霜對抗，心中有所反思。

葆晶與日進因女兒問題爭吵，葆晶暫住在以芯家。叢昕為海琪慶祝生日，海琪深受感動；叢昕正想表白，卻因海琪接到炳良最新病情通知而。卓盈察覺柏熙情緒異常，柏熙斷然否認。新聞間接證明了以芯的清白，但懷霜將叢昕從倫理評審會拉下，兩人正式決裂。患有先天氣管狹窄的白思雅再次入院，叢昕與海琪回想起當年作為實習醫生的日子。芝樺向以芯求助，甘楓誤以為以芯想撮合自己與芝樺。柏熙情緒不穩，突然對勵寶大發脾氣。

葆晶看到病童因父母關係惡劣而產生疼痛，從中有所覺悟。病童林劍培懷疑感染第五病，情況隨後突然惡化，有感染風險的以芯為他進行急救。以芯等候病毒檢測結果時，甘楓費盡心思為他打氣，並發現以芯原來對自己動了心。思雅得知需要再次手術更換氣管支架，驚恐發作；叢昕與海琪全力為她尋找新的解決方案。海琪決定離婚，炳良卻翻臉指責海琪同樣是背叛者。振堯靠攏懷霜，遵照她的建議，強制將已成年的兒科病人轉往成人科，振堯更強行接手思雅的手術。

柏熙受藥物影響情緒逐漸失控，與懷霜發生激烈衝突，更出現嚴重副作用。以芯確診感染病毒，隨後需要接受緊急手術。懷霜的坐骨神經痛愈發嚴重，但她對柏熙的情況放心不下，堅持拒絕手術。振堯堅持親自處理思雅的手術，一眾醫生對振堯的能力表示質疑，暗自為思雅擔憂。叢昕決定故技重施，與海琪密謀將思雅的手術當作緊急個案，提前進行手術。卓盈再度發現柏熙企圖濫用藥物，勸阻時反被他弄傷。

海琪與叢昕因如何處理柏熙偷藥事情大吵一架，海琪認為叢昕不擇手段。叢昕向振堯請求讓他擔任思雅手術的副刀。柏熙坦承自己因情緒病而濫用藥物，主動申請休假，振堯則以此事威脅懷霜。卓盈欣慰柏熙終於願意面對問題，兩人和好。振堯查出甘楓私自更改醫療報告，召開會議追究責任，並追究知情不報的海琪與葆晶。明珠帶著幾位從私家醫院跳槽的醫生進駐安妮醫院；以芯回到醫院復工時，才發現小兒外科已發生巨大變化。

以芯得知甘楓私自更改醫療報告後大感錯愕，向甘楓追問緣由。卓盈收到美詩的舊照片，查證後驚覺懷霜竟是美詩手術的主刀醫生。海琪與葆晶認定叢昕暗中告密，開始將他視為陌生人。振堯與明珠提出更換醫療器材供應商，叢昕沉著應對。柏熙與卓盈發現美詩的手術報告內容異常，柏熙追查後懷疑另有隱情。安妮醫院聯同醫學院與麾濤合作，開展突破性的3D列印研究計畫。叢昕察覺懷霜與麾濤之間隱藏著千絲萬縷的關係，以芯也接收到一個震撼性的消息。

少女程念璇因盲腸炎入院，其父程志斌極度緊張。甘楓向明珠提出加入3D列印研究小組的要求。眾人偶然得知，當日告密的不是叢昕，才明白一直錯怪了他。思雅因氣管支架變形再次入院，叢昕驚覺支架竟出自麾濤。振堯為避免事件擴大，拒絕再讓叢昕參與手術。麾濤有意注資兒科中心，以芯使計找出麾濤的老員工，老員工坦承內情。叢昕離開醫院時，突然看到程志斌抽搐痙攣，命懸一線。

明珠的下屬張梓立私下找上甘楓，希望他接手為霏雨做手術，然而甘楓對此毫無把握。程志斌將怨氣遷怒於叢昕，投訴他專業失德。叢昕接受委員會聆訊，遭到部分委員挑剔，指他用字前言不對後語。叢昕獨自來到美詩墓前，意外遇上懷霜。甘楓逐一追查3D列印研究報告中提及的外國醫療機構，揭發重大秘密。卓盈發現兒童院郭院長留給她的一封信，信中道出長久隱藏的真相。懷霜自告奮勇為霏雨進行手術，再次與叢昕、甘楓一同踏進手術室。