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第1話【忍者與殺手的相遇】，「拜託了…可以施捨一點食物給我嗎…」草隱里子是一名被夥伴牽著鼻子走就逃離村子成為逃忍的女忍者。倒在巷子裡的她，被一名路過的女高中生古賀木葉拯救了。然而才正喘了口氣，忍者追兵就找到里子了！就在面臨無處可逃的危機時，木葉竟然輕輕鬆鬆就擊敗了追兵！？

第2話【忍者與殺手的日常】，「哇…好多錢喔！」里子從木葉手中收到第一次「工作」的報酬而感到興奮不已。兩人馬上為了取得忍者服以外的衣服前去購物，然而在逛了各式各樣的店家之後，木葉仍然不幫里子買衣服。此時木葉突然催促里子去上廁所，里子身後則潛伏了一道黑影。

第3話【忍者與殺手的工作】，「我想打工看看！！」里子覺得自己好不容易來到城裡，想要試著挑戰各種事情，於是開始找打工，然而毫無學歷與常識的忍者面試根本不會上。在木葉的協助下偽造各種經歷之後重新挑戰，但里子身為忍者卻完全不會說謊，所以還是持續面試失敗。此時，有一通電話打了過來…。

第4話【忍者與殺手的關係】，「那個…我今天可以睡這邊嗎？」受到老大與百合子的影響，里子想嘗試與木葉變得更加友好，然而態度冷漠的木葉卻說她只是借住的工作夥伴而已。里子去向老大請教增進感情的祕訣之後，馬上進行老大傳授的能受歡迎的建議…。

從忍者之里逃出的女忍者里子，在街上因體力不支倒下時，被路過的女高中生木乃葉救起。但，好景不長，里子的蹤跡很快就被來自忍者之里的追兵發現，這些追兵竟被木乃葉輕易地反殺。沒想到，她的真正身份竟是一名殺手！世事不懂的女忍者與殺手女高中生的危險同居生活就此展開！