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第185集【二十年後的殺機、交響樂號連續殺人事件（四之一）】，在小蘭堅持參加報上一項可以免費參加前往小笠原的海豚之旅的趣味徵答之下，最後終於搭上了前往小笠原的輪船，免費招待的名額除了柯南以外一共有十位，眾人上了船後才知道20年前爆發強盜殺人案的主謀達才三也在船上，於是前刑警鮫崎與毛利便展開地毯式的搜索...希望能將他找出來。

第186集【二十年後的殺機、交響樂號連續殺人事件（四之二）】，就在眾人都在休息室裡玩牌喝飲料的時候，20年前的強盜殺人案的法律追訴期也在此時過去，但是眾人卻聽到一聲突然的槍響，衝至甲板時發現船桅上的旗子著火，放置急救救生梯的箱子也冒著熊熊火焰，箱子裡還有具焦屍，燒得面目全非難以辨識，兇手到底是誰？目的何在？那具焦屍又是誰呢？謎團尚未解開之際，服部平次又被兇手打落海裡...

第187集【二十年後的殺機、交響樂號連續殺人事件（四之三）】，繼服部平次失蹤後，鯨井也跟著受了槍傷，而蟹江則是舉槍自盡，但是一切仍然沒有得到結果，在柯南重新堪驗過屍體，並在船上人員的協助之下檢查過海老名的房間後，終於將一切理出了頭緒，案子眼看就可以破了。

第188集【二十年後的殺機、交響樂號連續殺人事件（四之四）】，柯南將事情從頭到尾想過，綜合船上各處留下的證據，與阿笠博士打來電話告知服部平次被兇手推落海裡遇救一事之後，果然將整件案子整理出頭緒，撥亂反正，將團團的迷霧撥開，揭發了事實的真相，兇手其實就是設計一切誣陷蟹江是兇手的...

第189集【慘遭四次殺害的男子】，小宮山泰司是一位著名的男演員，卻在三天前遇害，被發現陳屍在舞台後台的休息室中，問題是竟然突然冒出三個人自稱自己就是兇手，他們既非共犯，為何要堅稱自己殺了人呢？兇手到底是誰？小宮山又做了什麼事引起這般人神共憤？

第190集【與黑暗組織再次重逢，灰原篇】，灰原篇灰原幾度因為夢到自己被黑暗組織的金恩找到，槍殺身亡而嚇醒，一天竟然真的在路上看到了金恩和沃克，柯南藉由竊聽器得知組織計劃在戶杯飯店暗殺某人，為了阻止此事也為了調查將他們身體縮小的毒藥，柯南與灰原一起進入追悼會場，沒想到憾事仍然發生了...

第191集【與黑暗組織再次重逢，柯南篇】，柯南篇吞口議員死於美術燈下，柯南雖掌握了兩樣證物，但仍不足以揪出兇手，就在兩人想要暫時離開會場時，兇手“匹斯可”撇見了灰原，從組織的資料中調到她的長相，便將她囚禁在一酒窖中，灰原趁機將有關APTX藥物的資料存入阿笠博士的MO磁片中，希望新一能在事後去拿...誰知金恩在此時趕到...

第192集【與黑暗組織再次重逢，解決篇】，解決篇灰原照著柯南的指示喝下了從酒窖裡找出來的“白乾兒”後，從組織裡調了APTX的資料存入阿笠博士的MO中，身體變起了變化，竟然在短時間內恢復了大人的形貌，也終於得已爬出煙囪，誰知等在上面的是金恩；就在灰原好不容易脫離毒手後，卻又碰到黃雀在後，兇手“匹斯可”出現...

第193集【卡車直衝咖啡店事件】，大原一雄是一企劃公司的社長，多年來提拔公司內的設計師：相田恩情不小，但相田見公司沒有發展，意欲跳槽，還想領取公司的退職金，大原一時心有不甘，便設下謀殺陷阱，引著相田跳進去，最後死於被快遞貨車撞死的假象之下...

第194集【紅色殺機夢幻曲（上）】，加那娛樂集團的會長為了與知名民謠歌手杰拉爾．天馬訂訂契約，特別於自家安排了宴會，宴會日期決定後，他的夫人美放卻陸續受到騷擾，便邀毛利先生到府餐會，誰知歹徒就在此時攻擊美放夫人，歹徒到底是誰？他的目的何在？

第195集【紅色殺機夢幻曲（下）】，在天馬先生遇害之後，眾人都懷疑善則先生的動機，在目暮警官詢問眾人口供之際，柯南首先找出了案發現場各處的端倪，利用麻醉槍將毛利叔叔迷昏，便開始進行破案的推理，沒想到真兇竟然是...

第196集【九道門大搜索】，一天柯南一行人走在路上，空中突然掉下兩個S型掛勾和一枚戒指，在光彥等人的好奇心之下，決定上旁邊的大樓一探究竟，沒想到在眾人逐一釐清謎團之後，竟然真的阻止了一件慘劇的發生，即時救出被囚禁的上原美里太太。

第197集【危險的食譜】，柯南與元太一行人在百貨公司裡玩累時，坐在椅子上玩起菜單推理的遊戲，竟然發現有個人買了具有強烈毒性的“克羅尼”，便循線追查，發現一個名叫村上，年紀20許的年輕人竟然將他買來的材料作成了鼴鼠丸子，想要拿去毒害...

第198集【詛咒假面的冷笑（上）】，毛利先生受到前歌手現任“艷紅宣傳公司”社長的蘇芳女士之邀參加宴會，在帶著小蘭，柯南一起赴會時，半路檢到一封恐嚇信；進入蘇芳女士宅邸後，又被邸內怪異的慣例和規矩所震懾，誰知當天晚上“蕭布爾的假面”竟然就詛咒性的害死了蘇芳女士，究竟真是詛咒作祟，亦或是另有兇手？兇手又是如何在密室狀態下行兇的？

第199集【詛咒假面的冷笑（下）】，就在眾人一直困在密室殺人案的迷團裡面，甚至認為兇嫌應該是住在西廂房裡的五個人時，柯南突然想起一個人說的一句話，也正因此將一切的疑竇都連了起來，在柯南的推理下，終於指出真兇就是……

第200集【名偵探遇害記（上）】，毛利帶著女兒、柯南到一山莊度假巧遇飾演電視連續劇中名偵探的的超人氣偶像：砂岡和義、卻在短短的晚餐時間發現來自演藝界的這一行人中暗潮洶湧，最後砂岡竟然遭人射殺，兇手竟然是從對面懸崖上開的槍、從時間上來看、山莊內的人都有不在場證明、兇手到底是誰？柯南又該如何破案呢？

第201集【名偵探遇害記（下）】，新一認為兇手秏費工夫原因是要製造不在場証明，柯南觀察到散落的玻璃碎片正是破案關鍵，並找出了真正殺害砂岡的兇手。

第202集【黑暗中的神秘槍響】，毛利小五郎受到一電視節目製作公司社長之邀去保護她的母親，誰知一到她的住處不久，便發現她的母親勝江夫人額頭中彈一槍斃命，經過一番抽絲剝繭之下，赫然發現兇手竟是親生女兒：悅子小姐，她究竟為何殺人？動機何在？

第203集【生死一瞬間、偵探隊洞窟探險記】，阿笠博士帶著柯南，灰原一行人來到山上露營，誰知在撿拾柴火的過程中，光彥發現一鐘乳洞，眾人決定下去探險，卻意外發現一宗謀殺案，但此發現也使他們自己陷入危機之中，兇手三人不斷在洞窟內追逐，柯南又中彈流血過多，元太他們將如何脫逃呢？

第204集【生死一瞬間、名偵探負傷記】，元太三人在沒有柯南的幫助下終於順利解出“祥龍之路”的謎題，在阿笠博士和目暮警官的幫助下終於順利將柯南送到了醫院急救，還好一切沒有造成不可挽回的悲劇，誰知就在輸血時，柯南竟然發現小蘭已經知道他真實身份的事實，他該如何自處？他會將一切向小蘭全盤托出嗎？

第205集【生死一瞬間、第三個選擇】，柯南認為小蘭已經知道一切，原本想對她和盤托出的時候，灰原竟然用槍指著他，要他假設一切被黑暗組織知道的狀況下該如何應變，也讓柯南開始重新考慮；小蘭在學校的園遊會中參加話劇演出，誰知演出到一半，竟然有人中毒身亡，下毒的是誰？用的又是什麼手法？

第206集【生死一瞬間、黑衣騎士】，就在眾人都驚訝於鑑識的結果，並且將命案指向自殺案件的時候，黑衣騎士突然走了出來否定眾人，而這個黑衣騎士竟然就是睽違已久的工藤新一，在眾人瞠目結舌之下，新一順利的破解了凶手的犯案手法，誰知身體卻在此時發痛，難道他會當著大家的面前縮小嗎？

第207集【生死一瞬間、新一回來了】，小蘭一大早就跑到新一家去找他，因為她還不太能相信新一回來的事實，新一自己也無法從柯南的身分轉移過來，還時常會說錯話，至於柯南的角色只有由灰原暫時做替身，新一為了向小蘭表明心跡，特別請她上高級餐廳吃飯，誰知竟然又碰上了命案，新一被迫先去處理案子，但他究竟想對小蘭說什麼呢？

第208集【生死一瞬間、約會的地點】，新一雖然認定了兇手就是在遊樂器公司裡擔任經理職務的大場，卻仍有兩個疑點待決，在他聽到職員間無意間的言談後，終於掌握到證據，明白的表明認定大場就是兇手的原因，最後大場終於認罪，而新一卻在這個時候變回了柯南，小蘭還在等他，他該如何對她交代呢？

第209集【饒富意味的音樂盒（上）】，裕木春菜與緒方秋悟以叩機通信交友已有３年的時間，但自去年聖誕節相約見面對方未到，反而將音樂盒和叩機送給她後，便一直無法聯絡，春菜委託毛利終於找到了緒方家，誰知秋悟先生早已過世...

第210集【饒富意味的音樂盒（下）】，繼小蘭看到紙窗上老人晃過走廊的影子，緒方家的長子阿稔也被古箏打傷額頭，原來這一切都和過世不久的緒方老爺子，也就是春菜的叩機之友秋悟先生收藏的一組市價２億日圓的郵票有關，設下這一層層機關與迷團的人竟然是緒方太太...

第211集【看不見的凶器、小蘭的首次推理】，小蘭與園子在前往赤王子飯店的路上與開車昏睡的吉野千惠巧遇，小蘭意外的發現她看似體貼的老公遇到危險竟不告知自己的妻子，又得知千惠保了巨額保險，就此疑心大起，努力追查任何有可能危害千惠的原因...

第212集【超級跑車的陷阱（上）】，毛利小五郎因為抽中頭獎，獲得免費招待到霧峰飯店住宿，便帶著小蘭和柯南一起到飯店住宿，柯南在此看到許多難得一見的古董級名貴跑車，誰知這些跑車竟然牽扯到飯店社長和眾人之間的恩怨糾葛，最後社長竟然死在停車場中，這究竟是意外，還是他殺？

第213集【超級跑車的陷阱（下）】，霧峰飯店的寺泉社長陳屍在停車場的帝諾跑車駕駛座上，毛利本來認定這是宗意外，誰知車窗又沒有關好，就算燃料燃燒不完全，車內有廢氣排入，也不該將人毒死，此時警衛野田的一番證詞提供了柯南一條極大的線索，因為他在發現屍體前竟然看到同一車位上有另一輛車...

第214集【毛利小五郎涉嫌記（上）】，毛利帶著小蘭與柯南來到輕井澤的飯店度假，恰巧碰上與律師友人一同來此散心的分居老婆妃英理，誰知英理想將結婚紀念日的禮物送給毛利時，卻發現他涉嫌殺害同行的冰律師，英理要如何找出證據才能為自己老公脫罪呢？