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第1集【阿羅拉!最初的島嶼和最初的寶可夢們!!】，小智跟皮卡丘來到阿羅拉地區旅行。自然資源豐富的阿羅拉地區，充滿許多未知的魅力。在這裡還有學得到寶可夢知識的殿堂──寶可夢學校。興奮不已的小智，當天夜裡被一個神秘的聲音吸引到了屋外……

第2集【守護神卡璞．鳴鳴登場!挑戰我們的Z招式!!】，小智和皮卡丘寄宿在同樣是寶可夢學校老師的庫庫伊博士家中，然後開始他的通學生活。某天，班上的同學說要幫小智辦一場充滿驚喜的歡迎會！在歡迎會氣氛嗨到最高點的時候，據說是島嶼守護神的寶可夢卡璞．鳴鳴突然出現了？

第3集【請洛托指教 我是洛托姆圖鑑洛托!】，小智從寶可夢學校的老師──庫庫伊博士那裡收到新的寶可夢圖鑑。沒想到這竟然是個會說人類語言的劃時代寶可夢圖鑑，名字就叫做「洛托姆圖鑑」！小智為了收服他在阿羅拉的第一隻寶可夢，就前往了森林。另一方面，火箭隊也來到了阿羅拉地區！

第4集【木木梟登場!在阿羅拉收服寶可夢吧!!】，有一天小智遇到一隻餓著肚子的草羽寶可夢──木木梟。小智為了收服木木梟前往森林，卻在森林裡發現啄木鳥寶可夢──小篤兒們的巢穴！原來這隻木木梟是跟小篤兒們一起生活的。可是，火箭隊這時卻突然出現了！？

第5集【球球海獅 努力吹氣球!】，小智今天也繼續到寶可夢學校上課。今天的課程是由班上熟悉大海裡的寶可夢的──水蓮同學擔任特別講師，她要教大家如何騎著寶可夢來釣魚。在每個人享受完釣魚的樂趣之後，時間也來到中午休息的時刻。小智下午也想繼續努力釣魚，可是寶可夢們卻被一道神秘黑影襲擊了！！

第6集【麻麻刺刺的托戈德瑪爾!】，小智今天一個人看家。雖然他很努力地想要準備午餐，卻怎麼也煮不出一道菜來，還把所有食材都用光了。小智到附近的購物中心去買東西時，遇見了同學馬瑪內和他的蜷縮寶可夢──托戈德瑪爾。在他們東西買到一半的時候，購物中心突然停電，小智和馬瑪內也和寶可夢們走散了！！

第7集【市集的漫遊者火斑喵!】，小智到寶可夢學校上課的途中，遇見一隻野生的火貓寶可夢──火斑喵，還被牠搶走了自己的便當！正當小智四處尋找火斑喵的時候，剛好看見牠跟暹羅貓寶可夢──貓老大搶東西時受傷了。小智把火斑喵帶回家裡替牠療傷，可是不習慣和人類親近的火斑喵卻逃走了……

第8集【誰是蛋的照顧者?】，寶可夢學校的大木校長出了一道作業，要小智等人觀察並培育在拉納基拉山發現的蛋。眾人決定夜裡讓不敢摸寶可夢的同學莉莉艾，把那顆蛋帶回家裡照顧。小智陪著莉莉艾回家，發現她家是一座好大的宅邸。小智還在那裡跟莉莉艾家的管家進行了一場對戰！

第9集【霸主寶可夢是貓鼬探長!】，島上出現農田被拉達和小拉達破壞的事件！而小智在這個時候，遇見了島嶼之王──哈拉。小智立刻向哈拉提出他要挑戰諸島巡禮的申請，可是哈拉卻表示，他必須先測試小智是否具有挑戰諸島巡禮的資格……

第10集【Z招式會成功嗎?挑戰大考驗!!】，終於來到小智和島嶼之王哈拉進行大考驗的日子了！哈拉是擅長使用格鬥屬性寶可夢的高手，讓小智陷入苦戰。而小智，也以皮卡丘和木木梟來迎戰！在對戰中途，哈拉和他的夥伴鐵掌力士一起使出了Z招式！因此小智也全力以赴，以Z招式與他對抗！最後將有什麼樣的結果呢？

第11集【小智要去卡奇家!】，在寶可夢學校放假的這一天，小智一早就和他的級任老師──庫庫伊博士針對Z招式進行特訓。結果小智的同學卡奇，騎著噴火龍經過他們的身邊。據說卡奇在幫家裡的牧場送貨。對牧場很感興趣的小智，後來跑到了卡奇家去玩。沒想到那裡有好多的寶可夢!!

第12集【遇到好壞星的戶外教學!?】，火箭隊來到阿羅拉之後，每天都過著倦怠又懶散的日子。而這時，總部來了聯絡，想確認武藏他們在阿羅拉進行的活動是否順利。雖然火箭隊想辦法掩飾過去了，可是這樣下去不是辦法，於是他們決定要捕捉新的寶可夢。火箭隊來到海邊，剛好也遇到小智他們在附近進行戶外教學……。

第13集【阿羅拉鬆餅競跑大賽!】，小智從同學瑪奧那裡聽說，最近要舉辦一場鬆餅競跑大賽。這是要訓練家和寶可夢齊心協力，看誰能端好疊在盤子上的鬆餅，第一個跑回終點的比賽。對這場大賽產生興趣的小智，決定要和皮卡丘一起參賽。驚險萬分的鬆餅競跑，究竟會由哪一隊獲勝呢!?

第14集【勇氣的結晶 莉莉艾與六尾!】，大家一起悉心照料的蛋終於孵化了，小智等人都好高興！負責照顧蛋的莉莉艾，更是感動到不得了。可是，莉莉艾到現在還是不敢摸寶可夢。小智他們都鼓勵著莉莉艾，告訴她總有一天就敢摸了。這天放學時，莉莉艾在回家的路上看見一道奇怪的身影……

第15集【爪印之丘 岩狗狗與鬃岩狼人!!】，小智某天晚上回家後，發現負責看家的岩狗狗受傷了！嚇了一跳的小智與庫庫伊博士，為了確認岩狗狗在他們不在家的時候做了些什麼，裝了監視攝影機來觀察牠。當他們在觀察時，想不到牠竟然跑出門，不曉得要去什麼地方，趕緊追上去的小智等人，究竟會看見什麼呢!?

第16集【小小的三隻 大大的冒險!】，小智一群人跑到了海邊玩耍。想不到這時忽然刮起一陣大風，把裝了木木梟和球球海獅的氣球吹到別的地方去了！這時候，野生寶可夢火斑喵，出現在迷路的木木梟和球球海獅面前。雖然火斑喵想送牠們倆回去，可是火箭隊卻突然出現了…!?

第17集【阿羅拉偵探洛托姆!消失的純晶之謎!!】，某天，小智到寶可夢學校上學時，發現了一件很嚴重的事！那就是卡璞・鳴鳴送給他的重要電Z不見了！雖然小智非常著急，不過洛托姆自告奮勇說要幫他找出來。最近洛托姆迷上了偵探劇，因此想像名偵探那樣解謎。立即展開調查的洛托姆會遇上什麼事呢？

第18集【不會吧!?瑪奧的烹飪大作戰!!】，小智等人在同學瑪奧的邀請下，要試吃她家經營的艾納餐館的新菜色──幻之阿羅拉奶油燉菜。不過瑪奧這時卻面有難色，原來是要完成這道幻之阿羅拉奶油燉菜，就必須用到金黃色花蜜。可是這個季節，好像幾乎採不到這個花蜜。不死心的小智，隔天就和瑪奧一起出門去找花蜜……

第19集【猛烈的電擊特訓!再次挑戰卡璞・鳴鳴!!】，放學後，小智順道去了同學馬瑪內的家裡。為了在之前對戰過的傳說的寶可夢──卡璞・鳴鳴面前扳回一城，小智決定向熟悉電屬性寶可夢的馬瑪內尋求幫助。在馬瑪內家裡進行特訓的小智和皮卡丘，信心也跟著提升了，但沒想到卡璞・鳴鳴卻在這個時候出現了！

第20集【小智與皮卡丘 二人的約定】，某天，與班上的同學一起去買東西的小智，聽說了這附近有一座被稱為寶物島的小島。立即跑到那座島嶼冒險的小智，和皮卡丘一起獨處的時候，心裡對皮卡丘的喜愛變得更強烈了。就在太陽西沉之後，天空突然出現一道光芒，一隻神秘的寶可夢突然從天而降!?

第21集【火斑喵 啟程之時!】，小智在路上買東西的時候，忽然看見以前遇到的那隻火斑喵。他跟著火斑喵一起走，接著又看見那隻會指導火斑喵的年老長毛狗。後來沒過多久，火斑喵竟來跑來向小智求助！想不到那隻長毛狗的身體狀況非常糟糕……

第22集【小心鏟子!!】，小智和同學卡奇在海邊進行對戰特訓的時候，看見一個會在沙子上跑來跑去的神奇鏟子！卡奇告訴小智那是一隻名叫沙丘娃的寶可夢，要是去碰牠頭上的鏟子會出大事。可是，沙丘娃頭上的鏟子突然被打飛了，這也對小智帶來了麻煩……

第23集【太震撼了!三地鼠要拆夥!?】，小智他們和同學，以及庫庫伊博士等人一起去聽演唱會，他們要看的就是由三地鼠和訓練家DJ雷歐所組成的團體，人稱「三地鼠雷歐」的表演。小智一行人結識了DJ雷歐，並在那裡遇見一隻崇拜三地鼠的地鼠。翌日，新聞報導了一則震撼眾人的消息，那就是「三地鼠雷歐」要拆夥了!?

第24集【阿羅拉!第一次的教學觀摩!!】，小智在休假的某一天感到煩惱不已。原來是寶可夢學校最近要進行教學觀摩，邀請家長和當地的民眾來參觀，小智還要上台進行心得分享！這時出現一位意外的訪客，那就是小智的媽媽花子。為了看小智上台，她特地從關都地區飛到了阿羅拉！小智最後能順利完成他的心得分享嗎？

第25集【純晶爭奪戰!火箭隊對骷髏隊!!】，盯上小智的皮卡丘的火箭隊，某天在偷偷觀察寶可夢學校上課的情形時，對Z招式的威力感到震驚。他們想早點學會Z招式，於是開始四處尋找Z純晶。可是這個時候，在阿羅拉為非作歹的骷髏團卻突然出現了…火箭隊對骷髏團，這兩隊的壞蛋組合即將展開對決!!

第26集【再見了馬瑪內!】，小智聽說同學馬瑪內的爸爸媽媽，和他商量了有關搬家的事。馬瑪內必須和寶可夢學校的大家說再見了！雖然馬瑪內很想故作堅強，可是他的內心感到非常沮喪，根本就聽不下學校上的課。於是擔心馬瑪內的小智等人，決定展開一場行動…

第27集【出來吧!目光火紅的鬃岩狼人!!】，小智在寶可夢學校的休息時間時，聽說街坊上有一位非常厲害、使用鬃岩狼人的訓練家。小智為了和那位訓練家進行對戰，於是跑到了大街上找對方，想不到他竟然遇到了那位訓練家！雖然小智馬上向他提出對戰申請，可是莉莉艾卻在這個時候出現了…。

第28集【熱烈的寶可棒球賽!目標是敲出逆轉全壘打!!】，阿羅拉地區有一項非常受到當地民眾歡迎，名為寶可棒球的運動。小智和皮卡丘看見電視轉播的寶可棒球賽，也跟著激動不已！隔天小智到寶可夢學校上課時，庫庫伊博士說有個驚喜！那就是今天的課程，竟然要舉辦一場寶可棒球賽......。

第29集【你也來睡睡菇森林睡覺吧?】，小智和寶可夢學校的同學們，利用假日到森林裡露營。大家一起煮飯吃，還到河裡玩水，盡情享受露營的樂趣。可是，小智一行人卻開始一個接著一個倒地…據說這座森林有個會襲擊人的存在，不僅會奪走誤闖此處的人的記憶，甚至還會吸取人們的能量…

第30集【莉莉艾 要好好疼愛皮卡丘哦】，小智等人像平常那樣到寶可夢學校上課時，庫庫伊博士又有了驚人之語，那就是他希望大家互相交換夥伴寶可夢。其實這是課程中的一個環節，目的是為了讓訓練家們更了解不是自己夥伴的寶可夢。雖然皮卡丘要去莉莉艾家裡過夜，可是莉莉艾一直不敢觸摸皮卡丘…

第31集【麗姿出場!哭了又笑的島嶼女王!!】，小智今天的心情比平時都還要亢奮，是因為他要和同學們一起到阿卡拉島上課。此時，一位帶著鬃岩狼人的女性出現，她的名字叫做麗姿，而且她還是小智等人準備前往的阿卡拉島的島嶼女王。就在他們和麗姿一同前往阿卡拉島的路上，卻遇上了一個麻煩…!?

第32集【發現寶物!長毛狗搜尋!!】，小智和同學們來到了阿卡拉島，而他們今天要上的課，就是和自己選擇的坐騎寶可夢長毛狗一起去尋找寶物。可是，水蓮選擇的夥伴長毛狗，卻在途中開始不聽她的話，這使得水蓮陷入了苦戰之中。究竟小智一行人，是否能順利找到他們要找的寶物呢？

第33集【厲害的池塘霸主弱丁魚!】，小智等人盡情享受了在阿卡拉島上的時光。今天是自由活動的日子，小智和水蓮一起到附近的池塘去釣魚。聽說這座池塘裡，有一隻被稱為池塘霸主的巨大生物！於是小智和水蓮馬上跑到池塘釣魚。想不到這時水蓮的釣竿，竟然真的釣到那隻巨大的生物！

第34集【火焰對戰!嘎啦嘎啦現身!!】，小智等人參加了阿卡拉島的祭典。祭典的主要活動是幫寶可夢戴上王冠的儀式。根據當地的傳承，只要讓寶可夢戴上名為「維拉之冠」的王冠，寶可夢就能變強。正當小智等人帶著寶可夢參加儀式時，嘎啦嘎啦卻突然出現將王冠奪走了！

第35集【瑰麗的咖哩對戰!蘭螳花之舞!!】，正在進行戶外教學的小智等人為了製作阿卡拉島的傳統料理──阿卡拉咖哩，必須分組去收集食材。小智和瑪奧同組，他們要尋找三種食材。雖然一路上困難重重，還遇到一大群偽螳草和地鼠的阻撓，但小智還是順利收集到食材了。就在這時，蘭螳花突然現身要和小智對戰！

第36集【麗姿的大考驗!最艱辛的寶可夢對決!!】，小智終於要挑戰阿卡拉島島嶼女王麗姿的大考驗了。和麗姿對戰的大考驗是二對二的雙打對戰。小智決定派出木木梟和岩狗狗迎戰。擅長使用岩石屬性寶可夢的麗姿，用棘手的戰術和鬃岩狼人的壓倒性速度及力量，將小智玩弄於股掌之中。小智該怎麼辦呢！？

第37集【岩狗狗與生命遺跡的守護神!】，接受完麗姿的大考驗後，阿卡拉島的戶外教學迎來了最後一夜。但當天晚上，小智的岩狗狗卻失蹤了。雖然小智急忙跑出去找，但那晚還是沒能找到岩狗狗。隔天早上，小智等人繼續搜索岩狗狗，就在這時，某隻寶可夢突然現身了！

第38集【謎擬Q的畫皮!】，火箭隊為了捉皮卡丘，今天也向小智發起了對戰。但他們輸了被打飛到空中時，武藏和謎擬Q居然和其他人走散了。而且不巧的是，謎擬Q身上披的布居然破掉了。傷透腦筋的武藏，最後選擇的解決手段是…！？

第39集【離家出走的瑪奧與智揮猩!】，上課上到一半時，不知為何瑪奧的樣子看起來不太對勁。原來是因為有電視台要去採訪她父親經營的餐館！電視台開始採訪後，不只要招待節目製作人員，店裡還滿是客人讓瑪奧忙得團團轉！就在這時，瑪奧和父親因為一些瑣事大吵一架，她一時氣憤就衝動地跑出家門了！

第40集【球球海獅 花漾海獅 憤怒的破破舵輪!】，某天，小智和水蓮在海邊遇見了一隻很會表演的花漾海獅與牠的訓練家。他們得知了對方是環遊世界海洋的海洋居民，這次是為了尋找很久以前沉在這一帶的船才會來到這裡。小智和水蓮對海洋居民的生活起了興趣，決定幫他們一起尋找沉船，但這時火箭隊卻突然出現…

第41集【飛奔吧!蟲電寶】，蟲電寶競跑是在阿羅拉地區大受歡迎的賽車活動。比賽中使用的是將蟲電寶放在車身上，利用蟲電寶釋放的電力當能量運作的電動車。小智和馬瑪內還有卡奇決定組隊參加蟲電寶競跑！但開始練習後卻發現馬瑪內的蟲電寶跑不快…。他們有辦法拿下冠軍嗎？

第42集【阿羅拉 關都!小剛與小霞!!】，為了慶祝寶可夢學校創校20週年，寶可夢學校的師生來到了關都地區進行戶外教學。久違回到真新鎮的小智，也因為見到令人懷念的寶可夢還有小剛、小霞與大木博士等人而感到非常開心。正當他們觀摩到一半時，寶可夢們卻突然在大木研究所中迷路了…

第43集【道館對戰!Z招式對超級進化!!】，眾人繼續在關都地區享受戶外教學的樂趣。今天要到華藍道館體驗道館對戰。學生們接受特別講師小剛和小霞的指導，一邊上課一邊體驗道館對戰。其中，喜歡對戰的小智和卡奇向小剛和小霞提出想要認真對戰的請求。因此小剛和卡奇，小霞和小智決定各來一場激烈的對戰！

第44集【小智與小星雲!奇妙的邂逅!! 】，某天小智在上學途中遇見了第一次看到的寶可夢。他想起了他在夢中曾答應別人要負起責任照顧這隻寶可夢。但他撿到的寶可夢卻是連洛托姆圖鑑都沒有記載的謎樣寶可夢。由於不知道該如何照顧他，小智和寶可夢學校的同學們開始了各種嘗試。

第45集【引起騷動的小星雲!突如其來的瞬間移動!!】，小智一行人將撿來的謎樣寶可夢取了「小星雲」這個名字後，小智決定負起照料他的責任。在照料小星雲時，他們發現了一個驚人事實！沒想到小星雲居然會使用瞬間移動！小智等人就這樣一一被傳送到意想不到的地方去…

第46集【找出變身的百變怪!】，小智等人在莉莉艾的母親－露莎米奈的邀請之下，來到了專門保護受傷寶可夢的設施「以太樂園」。在園區裡，小智等人看到很多寶可夢，心情非常雀躍。但這時卻發生了一陣騷動，有一隻百變怪逃走了。小智等人雖然幫忙尋找百變怪，但卻一無所獲…。

第47集【格拉吉歐與銀伴戰獸!束縛的面具!!】，某天午後，小智偶然和莉莉艾的哥哥－格拉吉歐再會了。格拉吉歐身旁有隻小智第一次看到的寶可夢。格拉吉歐似乎不希望別人看到這隻寶可夢。而理由好像跟格拉吉歐還有莉莉艾的過去有關…。

第48集【以全力姿勢舉辦過夜派對!】，今天是開心的過夜派對，寶可夢學校的同學們都來到了庫庫伊博士的家。眾人邀請了芭內特和小卡比獸一起參加過夜派對，大家一起玩遊戲一起吃飯，氣氛非常熱鬧。當大家都睡著之後，芭內特卻看到莉莉艾獨自走到屋外。

第49集【 莉莉艾與銀伴戰獸 甦醒的記憶】，見到銀伴戰獸之後，莉莉艾又變得不敢觸摸寶可夢了。莉莉艾為了找回忘卻的記憶，決定到格拉吉歐那邊去。另一方面，以太基金會的扎奧博深怕莉莉艾恢復記憶後會揭發他過去犯下的錯誤，因此他打算綁架莉莉艾…。

第50集【扎奧博的反擊!被抓走的小星雲!! 】，莉莉艾恢復了過去的記憶，開始了充實的新生活。另一方面，過去犯的錯東窗事發而被逼入絕境的扎奧博，為了扭轉局勢決定鋌而走險。他打算利用小星雲的力量召喚出究極異獸！

第51集【 加油莉莉艾!下定離家出走的決心!!】，自從以太樂園的騷動之後，小星雲就再也不動了。小智等人雖然很擔心牠，卻又面臨了新的問題。沒想到莉莉艾和哥哥格拉吉歐居然一起離家出走了！因接連發生的問題而頭痛不已的小智，決定去找島嶼之王哈拉談談。

第52集【日輪祭壇!索爾迦雷歐降臨!!】，為了見傳說的寶可夢索爾迦雷歐，小智等人來到了位於波尼島的日輪祭壇。但索爾迦雷歐卻不在那裡，只看到卡璞・鳴鳴等阿羅拉地區的守護神在日輪祭壇齊聚一堂。在吃驚的小智等人面前，卡璞・鳴鳴牠們會採取什麼行動呢…！？

第53集【動作快!拯救露莎米奈大作戰!! 】，小智等人借助索爾迦雷歐的力量，終於穿越了究極之洞，來到了究極異獸所居住的世界。雖然小智等人試著將露莎米奈救回來，但遭到究極異獸控制的寶可夢卻擋在他們面前！

第54集【閃耀吧Ｚ強力手環!超全力一擊的千萬伏特!!】，為了拯救露莎米奈，小智等人不斷應戰。好不容易追上了露莎米奈，但受到究極異獸控制的她卻不斷抵抗。而且露莎米奈的寶可夢被打倒之後又重新站了起來，讓小智等人陷入危機！最後的結果究竟會如何呢！？

第55集【謝謝你索爾迦雷歐!我們的小星雲!!】，寶可夢學校的大家和傳說的寶可夢索爾迦雷歐同心協力，終於解決了和究極異獸有關的一連串事件。阿羅拉也恢復了以往和平安穩的日子。某天，庫庫伊博士突然向小智宣布一個重大消息…。

第56集【會睡的孩子最強!樹枕尾熊的秘密!】，小智等人在寶可夢學校做對戰練習時，樹枕尾熊突然出現在一旁。正當眾人聽大木校長敘述他和樹枕尾熊的邂逅時，胖丁卻突然出現。胖丁唱歌讓眾人睡著後，原想在樹枕尾熊臉上塗鴉卻塗不到，因此非常氣憤。小智等人只好開始思考讓胖丁和樹枕尾熊和睦相處的方法。

第57集【洛托姆!停不下來的形態變化!】，今天是寶可夢學校放假的日子。小智要和庫庫伊還有芭內特出門，因此叫洛托姆看家。雖然洛托姆充滿幹勁要好好看家，卻因為一場意外形態變化成清洗洛托姆。不只這樣，牠還變化成旋轉洛托姆跟加熱洛托姆等形態…。洛托姆究竟能不能順利變回原本的形態呢！？

第58集【不要哭,好壞星!】，火箭隊外出購物時，偶遇了好壞星以前仰慕的前輩！雖然現在的好壞星眼中只有小次郎一人，但前輩說即使如此牠還是喜歡好壞星。為了贏得好壞星的芳心，小次郎和前輩開始了激烈對戰。這場戀情究竟會如何發展呢！？

第59集【瑪奧和水蓮的苦甜回憶!】，某天，詩婷和詩涵在森林中迷路時，被謎樣的巨大寶可夢給救了。得知這件事之後，瑪奧和水蓮也想起自己小時候在森林迷路時，被她們稱為「森林爺爺」的巨大寶可夢給救了。因此，小智等人為了向牠道謝，決定到森林裡去。他們能否順利見到「森林爺爺」呢…？

第60集【莉艾跳起來!寶可雪橇跳躍大賽!!】，小智等人來到了拉納基拉山。看到一面雪白世界，大家都很興奮。在那裡，小智等人遇見了知名的寶可雪橇跳躍選手－莎拉，在莎拉的邀請下，小智等人決定參加寶可雪橇跳躍大賽，最後奪冠的會是誰呢？

第61集【出動!我們的究極防衛隊!! 】，究極異獸突然出現在美樂美樂花園！在露莎米奈的指示之下，小智等人以究極防衛隊隊員的身分出動。他們的目的是捕捉究極異獸，並讓牠回到原來的世界！小智等人的第一次任務有辦法順利成功嗎…！？

第62集【惡屬性喵喵是阿羅拉喵喵!? 】，喵喵珍藏的冰淇淋被武藏吃掉了，因此牠傷心欲絕地離開了秘密基地。就在這時，牠偶然遇見了阿羅拉喵喵。阿羅拉喵喵非常機靈，因此武藏和小次郎都希望牠能加入火箭隊，但喵喵卻非常反對…。

第63集【燃燒吧火斑喵!打倒熾焰咆哮虎!!】，小智在電視上看到阿羅拉傳統的4人混戰－皇家對戰後，非常感興趣，因此前往了會場。在那裡，小智和火斑喵將挑戰在皇家對戰中全勝無敗的皇家蒙面人，最後贏家會是誰呢！

第64集【小智與投擲猴!友情的達陣!!】，小智和皮卡丘到市場買東西時，遇見了爭吵中的投擲猴群。看來似乎是阿卡拉島和美樂美樂島的投擲猴在爭奪老大地位，而且美樂美樂島的投擲猴輸了。小智看到美樂美樂島的投擲猴這麼消沉，決定助牠們一臂之力。

第65集【伊利馬與伊布登場!!】，某天，小智等人在寶可夢學校進行對戰練習時，畢業生伊利馬突然現身了。瑪奧和馬瑪內說伊利馬是寶可夢學校創校以來的才子，而且還留下了許多傳說。小智等人為了親眼見證傳說，決定去找伊利馬。他究竟留下了哪些傳說呢？

第66集【用寫生來殺球!激鬥寶可桌球!】，今天寶可夢學校上的課程是訓練家和寶可夢一起打桌球的寶可桌球。庫庫伊請了伊利馬當特別講師，在他的指導下，小智等人也開始挑戰打寶可桌球！課程結束後，小智等人受邀到伊利馬參賽的寶可桌球大賽觀賽。伊利馬上次大賽敗在決賽，他這次能奪冠嗎！？

第67集【最喜歡皮卡丘!毒貝比轉啊轉!!】，寶可夢學校的課程進行到一半時，謎樣寶可夢突然出現在皮卡丘面前！其實牠和皮卡丘之前就見過面，牠似乎很在意皮卡丘，便將皮卡丘帶到學校外面去了。小智發現皮卡丘不見後慌張地開始找，但這時，火箭隊卻突然出現…。

第68集【工作體驗!寶可夢中心24小時!!】，今天是寶可夢學校的工作體驗日，但喬伊小姐卻感冒了。小智等人只好代替喬伊小姐做寶可夢中心的工作。這時，骷髏隊的人卻突然出現…。

第69集【閃耀星舟鐵火輝夜!】，某天，馬瑪內跟家人一起去露營時，在竹林裡發現了埋在土裡的謎樣銀色金屬。他和托戈德瑪爾還有蟲電寶將牠挖出來一看，才發現上面疑似長著一張臉。馬瑪內認為這可能是自己喜歡的童話故事「星舟輝夜」裡的輝夜也說不定。真相究竟為何呢…？

第70集【守護牧場吧!逆襲的藍色火焰!!】，一位名叫布魯根的男人突然出現在卡奇家的牧場，還說要將牧場買下來改建成渡假飯店。卡奇的家人拒絕了他的要求之後，他卻用盡各種手段企圖阻礙牧場的經營。生氣的卡奇決定和布魯根進行寶可夢對戰，但是…。

第71集【滴蛛,收服水蓮了! 】，在美樂美樂島的某座森林中，野生的滴蛛踏上了旅程，開始尋找屬於自己的水源。滴蛛在外面的世界第一次看到大海，在爭奪水源的對戰中輸給了別的滴蛛。就像這樣，滴蛛在旅途中有了各式各樣的經驗。但是，最令人意外的是，滴蛛居然愛上了偶然遇到的水蓮！？

第72集【登登登!燃燒吧瑪奧一家!!】，出外旅行學習烹飪技巧的瑪奧哥哥－烏魯，難得又回到老家艾納餐館來了。烏魯說想參加一年一度的阿羅拉麵包嘉年華，但其實他還有別的目的…。看來艾納餐館或許會發生一陣小騷動！？

第73集【火箭隊的諸島巡禮!?得到Z手環吧!!】，某天，火箭隊發現好壞星已經會用惡屬性的招式了，由於他們手上已經有惡Z，因此他們開始討論起該怎麼拿到Z手環。就在這時，坂木叫他們去找烏拉烏拉島的島嶼之王要Z手環。火箭隊有辦法得到Ｚ手環嗎！？

第74集【不良大叔是島嶼之王!?】，小智等人為了挑戰諸島巡禮，來到了烏拉烏拉島。可是他們到處都找不到島嶼之王。在島上的少女阿塞蘿拉的協助下，他們終於找到了島嶼之王默丹。默丹會讓他們接受大考驗嗎！？

第75集【卡璞・哞哞!懶洋洋的猛烈特訓!!】，小智為了變強，決定請島嶼的守護神卡璞．哞哞幫他特訓。在阿塞蘿拉的帶路之下，小智終於順利來到卡璞．哞哞面前了，但卡璞．哞哞卻不打算理會他…。

第76集【超級決戰!皮卡丘VS謎擬Q!!】，學會用Z招式的武藏等人，為了抓皮卡丘而展開行動。為了挑戰默丹的大考驗，變得更強的小智＆皮卡丘將和得到Ｚ手環的武藏＆謎擬Q展開一場激烈對戰！

第77集【默丹的大考驗!鬃岩狼人覺醒!!】，小智終於要挑戰默丹的大考驗了。烏拉烏拉島的大考驗內容為挑戰者必須用一隻寶可夢連續打倒默丹的三隻寶可夢。默丹一開始派出的是流氓鱷。小智和鬃岩狼人是否能發揮特訓的成果，突破大考驗呢！？

第78集【激戰究極異獸!火光四射大作戰!!】，小智一行人去看了美樂美樂島的煙火大會。在那裡，他們偶然看到一個煙火人（？）做出了節目表上沒有的表演。隔天，一行人在學校聊這個話題時，突然接到究極防衛隊出動的指令。這次的指令似乎跟謎樣煙火人有關係，他的真面目究竟是什麼呢…？

第79集【小隕星與毒貝比、消逝在星空的約定!】，今天是寶可夢學校的學生去校外教學的日子。小智一行人要到輝克拉尼天文台觀察流星寶可夢．小隕星。在那裡，小智一行人偶然遇見了掉到地面上的小隕星。雖然他們很快就和小隕星變成朋友了，但小隕星這種寶可夢其實還藏有一個秘密…。

第80集【穿山鼠風暴!冰洞的雙打對戰!!】，小智等人為了回美樂美樂島，打算繞近路從洞穴走回乘船處，但卻迷路了，而且大家都走散了。就在這時，莉莉艾、瑪奧、馬瑪內遇見了阿羅拉穿山鼠，穿山鼠們似乎有個想戰勝的對手，莉莉艾為了幫牠們，會採取什麼行動呢…？小智等人能否順利走出洞穴呢！？

第81集【阿羅拉的年輕火焰!皇家小智誕生!!】，皇家對戰在阿羅拉地區非常流行，小智在電視上看到皇家蒙面人的活躍後，決定和庫庫伊博士還有芭內特博士一起到皇家巨蛋去看比賽。但是，皇家蒙面人的對手卻一直使出骯髒的手段，看不下去的小智和炎熱喵居然也跑上了擂台！？

第82集【要不要用跳舞進化呢!?】，寶可夢學校要舉辦訓練家幫寶可夢編舞，讓寶可夢跳舞的「寶可舞蹈」發表會。大家為了充分地將搭檔寶可夢的魅力表現出來，紛紛開始編舞。發表會上會看到哪些精彩的舞蹈呢！？

第83集【小智變小了】，今天寶可夢學校請到以太基金會的扎奧博當特別講師。為了讓孩子們對科學產生興趣，他準備了一台可以將任何東西變小的機器。本來大家很期待扎奧博示範它的功能，但機器卻完全不動。雖然之後好不容易才動起來，卻不小心將小智等人變小了…。

第84集【家人的形式，毒貝比的心情!】，某天黃昏，小智在市場遇見了一位畫技很棒的女性。她的名字叫茉莉，似乎擁有感應寶可夢心情的力量。她一看到毒貝比就知道毒貝比喜歡畫畫，而且還感受到毒貝比的心情…毒貝比內心究竟在想什麼呢？

第85集【飛吧攀登吧,壘磊石!】，寶可夢學校的操場突然出現一個巨大的跳箱。小智等人以為那是庫庫伊博士為了上課準備的，紛紛上前想挑戰。但就在這時，究極防衛隊突然接到緊急出動的請求！到底又出現了什麼樣的究極異獸呢？

第86集【就決定是這裡了!寶可夢溫泉天堂!!】，小智等人來到了專門為寶可夢打造的渡假村「寶可夢天堂渡假村」。由於最近究極防衛隊頻繁地出任務，因此露莎米奈特地招待他們到渡假村休息。可是火箭隊卻暗中盤算著想抓小智等人的寶可夢…。

第87集【阿羅拉的危機!吞噬光輝的黑暗!!】，某天早上，小智發現庫庫伊博士和芭內特博士看起來跟平常不一樣，非常沒有幹勁。在阿羅拉罕見的陰天中，小智來到了寶可夢學校。他和大家聊過後，發現大家的爸爸媽媽似乎都很沒有精神。為了解開這個謎，露莎米奈命令究極防衛隊出動…！？

第88集【露奈雅拉vs UB:漆黑!滿月之戰!!】，露奈雅拉和一隻神秘寶可夢突然出現在究極防衛隊面前。正當露奈雅拉和神秘寶可夢激戰時，企圖捕捉他們的火箭隊突然出現！而且連索爾迦雷歐都來了…！阿羅拉地區究竟會變成什麼樣子呢…！？

第89集【光輝與黑暗的稜鏡,其名為奈克洛茲瑪!】，為了拯救阿羅拉脫離危機，小智等人究極防衛隊的成員前往究極之洞另一頭的世界。在那裡等著他們的是什麼呢…？火箭隊真正的目的又是什麼呢？小智等人要如何讓阿羅拉地區恢復和平呢？

第90集【通往未來!光輝大神的傳說!!】，小智一行人終於查出光輝大神傳說的真相。但卻不知該怎麼做才能讓阿羅拉地區脫離危機…。正當小智等人煩惱時，卡璞・鳴鳴採取了某個行動！大家同心協力一同取回阿羅拉的和平吧！去吧！小智！加油啊！究極防衛隊！

第91集【大量出現中!皮卡丘山谷!!】，小智一行人來到住了大群皮卡丘的皮卡丘山谷玩。在那裡，他們遇見了一位名叫皮卡菈，超喜歡皮卡丘的奇妙大姊姊。小智一行人受到皮卡菈和山谷中的皮卡丘歡迎，正要和樂融融地一起玩時，企圖抓皮卡丘的火箭隊卻突然出現在山谷裡…！

第92集【庫庫伊陷入危機!另一個皇家蒙面人!!】，皇家巨蛋最強的皇家蒙面人要到美樂美樂島辦握手會了！小智和芭內特博士得知消息後，馬上說想跟庫庫伊博士一起去握手會。但庫庫伊博士不希望自己身為皇家蒙面人的秘密曝光，他要怎麼度過這個危機呢！？

第93集【勇者莉莉艾爾與阿羅拉之杖!】，今天寶可夢學校要在體育館舉辦話劇發表會。小智和寶可夢學校的同學們雖然緊張，還是在家人面前努力地表演話劇。就在這時，火箭隊偶然撿到小智的劇本，就這樣跑上舞台跟他們一起演戲，發表會究竟會變成什麼樣子呢！？

第94集【幽靈寶可夢大集合!大家的鬼屋!!】，某天，水蓮的妹妹詩婷和詩涵突然說想要去鬼屋玩。水蓮在寶可夢學校跟大家說了之後，剛好來學校辦事的阿塞蘿拉便提議自己動手做鬼屋。他們究竟會將學校佈置成什麼樣的鬼屋呢？

第95集【維拉火山 隆隆石隆隆岩登山男!】，以維拉火山為中心出現了磁力異常的現象！由於這樣會對究極氣場的探測造成影響，因此露莎米奈請小智他們究極防衛隊的成員到現場去調查。小智等人是否能查出異常現象的原因呢？

第96集【火箭隊與童偶熊!】，小智一行人來到了以太樂園。這一天，火箭隊剛好也來到了以太樂園。火箭隊的目的是將以太樂園保護區內的寶可夢全都一網打盡。但不知為何，他們卻遇到一隻一直纏著武藏不放的童偶熊。

第97集【達人投羽梟!!!沉睡的木木梟zzz】，小智在美樂美樂島的森林中，偶然遇見島嶼之王哈拉的孫子．哈烏。得知哈烏為了接受大考驗正在特訓中，小智馬上就邀哈烏和自己對戰。哈烏的投羽梟和小智的木木梟，對戰的贏家會是哪一邊呢？

第98集【小智和洛托姆要拆夥了!?】，小智一行人到阿羅拉偵探拉奇的錄影現場觀摩。在那裡，洛托姆被節目製作人看上，並受邀參與節目的演出。雖然洛托姆很開心，可是…。

第99集【伊布要去哪裡呢?為了見那孩子哪裡都能去!】，有隻伊布孤零零地在海邊吃樹果。這隻伊布似乎是為了見某人才到鎮上來的。可是牠卻被壞心眼的阿羅拉貓老大追著跑！伊布的命運究竟會如何呢！？

第100集【斬斷疾風的閃電!其名為捷拉奧拉!!】，某天小智前往寶可夢學校的路上，遇見了阿羅拉的守護神卡璞・鳴鳴。小智馬上向卡璞・鳴鳴提出對戰的請求。就在皮卡丘和卡璞・鳴鳴的電擊碰撞出激烈火花的瞬間，小智和皮卡丘一回過神來卻發現自己來到了陌生的地方…。

第101集【去吧!友情的雙重終極伏特狂雷閃!!】，由於某個原因，小智和皮卡丘來到了一個陌生的地方。那個地方不但沒有人影，連城鎮都變成荒蕪的廢墟了…。小智和皮卡丘得知造成這一切的元兇是某隻強大的究極異獸後，決定和捷拉奧拉還有迪亞並肩作戰！小智有辦法拯救孤軍奮鬥的迪亞和捷拉奧拉嗎！？

第102集【阿羅拉我來了!小剛和小霞登場!!】，當小智一行人準備放學時，小剛和小霞來到了寶可夢學校。由於他們兩個是第一次來到阿羅拉地區，所以小智一行人興沖沖地要帶他們去觀光。他們會去哪些地方玩呢？

第103集【粉碎岩石的熱血之心!麗姿和小剛!!】，小剛和小霞來到阿羅拉玩了。今天在小剛的提議下，小智一行人為了見島嶼女王麗姿而前往阿卡拉島。麗姿一聽說小剛以前是道館館主，馬上就對小剛提出對戰請求！兩人熱血的對戰結果會是…？

第104集【波尼島的自由研究!找出島嶼之王吧!!】，小智等人來到波尼島做自由研究。他們各自決定了自己的研究主題後，開始努力進行研究。這時，他們遇見了一位叫哈普烏的女孩子，但哈普烏卻以為小智是白蘿蔔小偷…，而且連骷髏隊也登場了，看來這將會是不平靜的一天！

第105集【鬃岩狼人決戰!小智VS格拉吉歐!!】，小智一行人在波尼島上做自由研究。正當莉莉艾在觀察波尼島的寶可夢時，卻遇見了哥哥格拉吉歐！格拉吉歐在波尼島做什麼呢…？小智和格拉吉歐的鬃岩狼人將展開一場激烈對戰！

第106集【有海有山谷!寶可夢進化大特訓!!】，想讓蟲電寶進化成鍬農炮蟲的馬瑪內，決定到有著奇妙力量的波尼大峽谷去。馬瑪內有辦法讓蟲電寶進化嗎！？另一方面，見到師傅伊雅跟西獅海壬的水蓮跟球球海獅，鼓足了幹勁想把師傅的招式全都學起來…。

第107集【奔跑吧卡奇!超越自己的極限!!】，小智和卡奇為了見波尼島的守護神－卡璞・鰭鰭，在彼岸遺跡進行了激烈的對戰。但他們在神聖之地進行對戰的行為觸怒了卡璞・鰭鰭，害小智被抓了起來！卡奇必須在時限內將卡璞．蝶蝶的鱗粉拿過來才能解救小智。小智和卡奇的命運究竟會如何呢！？

第108集【身處卡璞・鰭鰭的迷霧中】，格拉吉歐之所以會來到波尼島，是為了見彼岸遺跡的守護神－卡璞．鰭鰭。卡璞．鰭鰭似乎擁有神奇的力量能讓人見到去世的人。聽到這個消息後，瑪奧吐露出的真心話是…？

第109集【島嶼女王誕生!小智的大考驗!!】，在彼岸遺跡舉行完島嶼女王的就任儀式後，哈普烏就正式成為波尼島的島嶼女王了。小智終於得以挑戰大考驗了！小智會派哪隻寶可夢挑戰哈普烏的重泥挽馬呢！？他有辦法成功突破大考驗嗎！？

第110集【寶可高爾夫,一桿進洞!】，寶可高爾夫是在阿羅拉非常受歡迎的寶可夢合作運動。某天，小智一行人遇見了知名的職業高爾夫選手卡希麗和她的搭檔銃嘴大鳥阿鰹。他們決定在課堂上一起打寶可高爾夫！

第111集【登陸阿羅拉!坦錄坦錄金屬大騷動!!】，小智等人從波尼島搭船回來時，船上居然有一群神祕生物…？牠們不只闖入火箭隊的秘密基地，將小次郎最珍惜的收藏品吃掉，還跑到寶可夢學校吃掉馬瑪內帶來的工具，引發了一陣大騷動！這群神祕生物會是新種寶可夢嗎！？

第112集【發現新種!收服美錄坦!!】，小智請大木博士幫忙調查後，發現神祕生物真的是新種的寶可夢，因此他們幫牠取了美錄坦這個名字！可是才剛取完名，美錄坦就陷入了快被火箭隊捉走的危機！事情到底會怎麼發展呢！？

第113集【新節目!?小小鯉魚王的旋律】，小智一行人來到了電視台，要幫參加猜謎節目的馬瑪內加油。他們和「阿羅拉偵探拉奇」的製作人再會之後，受邀到錄影現場觀摩。在現場，他們看到了天才童星鯉魚王－小鯉。可是，小鯉的模樣看起來似乎有點不太對勁…？

第114集【美女與喵喵!】，某天晚上，突然發生了持有Z純晶的訓練家接連遇襲的案件！這起案子的犯人是究極異獸－費洛美螂！費洛美螂似乎正在收集Z純晶…？就在這時，喵喵居然愛上了費洛美螂！？

第115集【破壞的帝王古茲馬!】，為了聽庫庫伊博士宣布重大消息，小智一行人來到了以太樂園。博士發表的內容是「阿羅拉寶可夢聯盟」的舉辦消息。阿羅拉地區的民眾得知後都非常開心。就在這時，從電視上得知這個消息的骷髏隊老大－古茲馬居然闖進了寶可夢學校！他以前似乎和庫庫伊博士有過什麼過節…？

第116集【莉莉艾與秘密的機關公主!】，莉莉艾和格拉吉歐堅信父親莫恩還活著，因此到扎奧博的研究室尋找莫恩的研究資料。看到他們的模樣，露莎米奈決定帶他們去莫恩的房間。在那裡，莉莉艾找到了某樣東西──！

第117集【謝米,美錄坦,小渚!迷路探險隊!!】，小智一行人來到了烏拉烏拉島的馬利埃靜市觀光。在忍者導遊－穿孔竹輪的帶領下，眾人沉浸在觀光的樂趣中。就在這時，瑪奧的髮飾突然被風吹走了！為了追回瑪奧的髮飾，謝米、小渚還有美錄坦就這麼和大家走散了！？

第118集【目標是前往最高層!爆音的龍之道館!!】，小智一行人來到了馬利埃靜市以關都地區的道館為原型建設的遊樂設施－關都之道館。在那裡等著小智一行人的是不知為何穿著忍者裝的道館訓練家們！只要贏過各樓層的道館訓練家，就能在最高層和頭領進行寶可夢對戰。誰會最先抵達最高層呢！？

第119集【超高速鍬農炮蟲!馬瑪內覺醒!!】，馬瑪內要參加鍬農炮蟲競跑。為了得到冠軍獎品「蟲Z」，他拼命特訓！大賽當天，馬瑪內遇見勁敵疾風，兩人間擦出了激烈的火花。但火箭隊卻企圖趁比賽時將鍬農炮蟲一網打盡…。

第120集【水蓮釣到了蓋歐卡!?】，小智一行人來到了無人島玩，正當他們在海邊玩時，傳說的寶可夢蓋歐卡突然出現了！可是蓋歐卡看起來很沒精神…！？而且還出現了想捕捉蓋歐卡的寶可夢獵人！小智一行人有辦法保護蓋歐卡嗎！？

第121集【瑪奧奮鬥!森林寶可夢咖啡!!】，為了拿大蘑菇，瑪奧來到了智揮猩的店裡。店裡有很多寶可夢來光顧，非常忙碌，因此瑪奧也留下來幫忙！正當她忙著配合寶可夢的喜好端出一道道料理時，卡璞・鳴鳴居然也來了！瑪奧有辦法做出合卡璞・鳴鳴胃口的料理嗎！？

第122集【監視中!火箭隊阿羅拉的樣子!!】，火箭隊的武藏一行人不小心騙總部他們抓到穿著熊了。正當他們不知道該怎麼辦時，真鳥特地來到阿羅拉要帶走穿著熊。武藏們究竟該如何是好呢！？

第123集【掌握Z招式的精髓!灼熱的卡奇集訓!!】，為了參加阿羅拉寶可夢聯盟，寶可夢學校的同學們開始進行Z招式的特訓。在卡奇的提案下，小智和馬瑪內決定到卡奇家集訓。爆焰龜獸在集訓期間，一下陪鍬農炮蟲特訓，一下阻止調皮的嘎啦嘎啦亂來，就像是大家的好哥哥一樣。爆焰龜獸和卡奇又是怎麼相遇的呢…？

第124集【鋒利無比!紙御劍登場!!】，在童偶熊座流星雨即將登場的這天，阿羅拉各地發生了東西莫名被斬斷的事件！犯人是究極異獸紙御劍！小智等人究極防衛隊有辦法順利將紙御劍送回原本的世界嗎！？除此之外，還發生了驚人的事件…。

第125集【小智、穿越時空的邂逅!】，某天，芭內特博士找到庫庫伊博士小時候的照片。照片裡的庫庫伊抱著寶可夢超級招式圖鑑，和火斑喵站在一起。同一時刻，小智在森林中特訓時，幻之寶可夢時拉比突然出現。時拉比使出穿越時空，讓小智和炎熱喵回到了過去，這時他們遇見的是…。

第126集【皮卡丘的心動探險隊!】，小智和炎熱喵被時拉比的穿越時空傳送到過去了。他們後來順利回到現代和皮卡丘牠們會合了，但皮卡丘牠們卻全身髒兮兮的…。在小智和炎熱喵回到過去時，皮卡丘牠們究竟經歷了什麼樣的冒險呢？

第127集【格拉吉歐與莉莉艾!追尋父親的幻影!! !】，莉莉艾為了成功使出Ｚ招式，請小智等人一起來到家裡特訓。在那裡，莉莉艾為小智等人介紹靜止不動的幻之寶可夢－瑪機雅娜。莉莉艾無論如何都想讓瑪機雅娜動起來，可是…。另一方面，格拉吉歐在美樂美樂島的森林中遇見了某隻寶可夢…。"

第128集【開幕!阿羅拉寶可夢聯盟!!】，小智一行人終於來到阿羅拉寶可夢聯盟的舉辦地點－瑪納羅競技場了。他們各自去逛對戰場地和購物中心，但骷髏隊卻突然來攪局，引發了陣陣騷動。庫庫伊博士和古茲馬以前究竟有什麼過節呢…？

第129集【大亂鬥!皇家對戰151!!】，阿羅拉寶可夢聯盟的預賽－皇家對戰拉開序幕了！151組參賽選手將進行大混戰，最後剩下的16組選手才能晉級決賽淘汰賽！小智一行人有辦法打贏強敵，晉級決賽淘汰賽嗎！？

第130集【瑪奧與水蓮!友情的全力對戰!!】，阿羅拉寶可夢聯盟的決賽淘汰賽開始了！第一輪比賽的第一場比賽是小智0對上扎奧博，小智會如何破解扎奧博的策略呢！？第二場比賽是伊利馬對上古茲馬！第三場比賽是哈烏對上大木校長！然後第四場比賽是瑪奧VS水蓮超越友情的熱血對戰！！

第131集【武藏VS小次郎!愛與真實的對戰場地!!】，決賽淘汰賽第一輪賽程的第五場比賽是馬瑪內對上茉莉！最令人驚訝的是第六場比賽是武藏對上小次郎！火箭隊之間的對決，果然翁和好壞星，贏的會是哪邊呢！？然後第七場比賽是卡奇對上阿塞蘿拉，第八場比賽則是莉莉艾對上格拉吉歐的兄妹對決！

第132集【攻下狙射樹梟吧!】，為了和哈烏的狙射樹梟對決，小智和木木梟特地早起特訓。就在這時，銃嘴大鳥和小篤兒牠們也來了，牠們想教木木梟學會「羽毛舞」！木木梟能順利學會羽毛舞嗎！？小智跟哈烏的對決終於要開始了…！

第133集【鳥之決戰!勇鳥猛攻VS神鳥猛擊!!】，阿羅拉寶可夢聯盟決賽淘汰賽第二輪賽程，小智和哈烏的對戰正如火如荼的進行中。小智的木木梟千鈞一髮躲過了哈烏的狙射樹梟施放的Z招式。木木梟有辦法使出特訓的羽毛舞嗎？在小智和哈烏的對戰告一段落後，接下來就是卡奇對上馬瑪內的比賽了！

第134集【大家的全力!通往準決賽的道路!!】，阿羅拉寶可夢聯盟決賽淘汰賽第二輪賽程的第三場比賽是卡奇對上馬瑪內。卡奇和噴火龍面對徹底研究過卡奇戰鬥方式的馬瑪內和鍬農炮蟲，陷入了苦戰。他們兩個哪邊會獲勝呢？第四場比賽是水蓮對上骷髏隊的老大古茲馬…前四強終於要出爐了！

第135集【準決賽!卡奇VS格拉吉歐!!】，為了幫卡奇加油，他的妹妹星兒來到了瑪納羅競技場。就在這時，骷髏隊突然出現，這時拯救她危機的是卡奇準決賽的對戰對手－格拉吉歐！看到星兒，讓格拉吉歐想起了小時候的莉莉艾。準決賽第一場比賽是卡奇VS格拉吉歐。同樣身為哥哥的兩人將展開激烈的一戰！

第136集【熊熊燃燒的火焰!勁敵不只有一個!!】，阿羅拉寶可夢聯盟準決賽第一場比賽－卡奇VS格拉吉歐終於分出勝負了！第二場比賽是企圖毀掉阿羅拉寶可夢聯盟的骷髏隊老大－古茲馬對上小智。小智會怎麼迎戰擁有不敗傳說的古茲馬呢？

第137集【不敗的帝王古茲馬!】，準決賽第二場比賽，由於具甲武者的特性是「危險回避」，因此巨鉗螳螂突然被換上場，而且還輸給了炎熱喵。具甲武者擅作主張讓古茲馬非常生氣。他原本在比賽中佔上風，卻因為在小智身上看到年輕時的庫庫伊的影子，而逐漸亂了自己的步調…。

第138集【決賽!最強勁敵對決!!】，順利晉級阿羅拉寶可夢聯盟決賽的人是小智和格拉吉歐！雙方在家人朋友還有觀眾的熱烈歡迎之下，終於站上了決賽的舞台！能成為阿羅拉寶可夢聯盟初代冠軍的會是哪一邊呢！？

第139集【誕生!阿羅拉的霸者!!】，阿羅拉寶可夢聯盟的決賽終於開始了！小智VS格拉吉歐！小智的美錄梅塔被銀伴戰獸打敗後，他派出了皮卡丘打敗銀伴戰獸，然後皮卡丘和索羅亞克的對戰就這樣開始了。能奪下阿羅拉寶可夢聯盟初代冠軍寶座的會是哪一邊呢！？

第140集【惡食大王來襲!Z招式大決戰!!】，在阿羅拉寶可夢聯盟的初代冠軍頒獎典禮上，突然出現了究極異獸．惡食大王！面對破壞會場的惡食大王，小智一行人和皇家蒙面人還有島嶼之王、島嶼女王們將會挺身而出！

第141集【最終對戰!小智VS庫庫伊!!】，小智一行人順利將惡食大王送回究極之洞了！就在這時，大家得知了皇家蒙面人就是庫庫伊博士！當會場充滿驚訝與興奮的聲音時，小智和庫庫伊博士的表演賽終於要開始了！6對6的全面對戰，最後會鹿死誰手呢？

第142集【燃燒!情緒高漲!!全面對戰!!!】，小智和庫庫伊博士的表演賽越來越精彩了！小智的鬃岩狼人有辦法閃過勇士雄鷹使出的岩崩嗎！？還有，庫庫伊博士的妙蛙花和小智的木木梟究竟哪邊會贏呢…！？

第143集【決戰!熾焰咆哮虎VS炎熱喵!!】，小智VS庫庫伊博士的表演賽來到了四顎針龍VS路卡利歐的對決！四顎針龍的十字剪和路卡利歐的近身戰激烈碰撞！然後，下一場是炎熱喵和熾焰咆哮虎的對決。炎熱喵有辦法打贏至今從未贏過的熾焰咆哮虎嗎！？

第144集【阿羅拉最強的Z!卡璞・鳴鳴VS皮卡丘!!】，卡璞・鳴鳴臨時和庫庫伊博士搭檔，代替庫庫伊博士的第6隻寶可夢參加了表演賽。因此最後一場比賽變成皮卡丘VS卡璞・鳴鳴的命運對決！雙方的Ｚ招式在對戰場地上激烈碰撞，最後贏得表演賽的會是哪一邊呢！？

第145集【太陽與月亮與大家的夢想!】，阿羅拉寶可夢聯盟結束後，大家又回到了平凡的日常生活中。庫庫伊博士在寶可夢學校問大家放長假有什麼打算。小智聽了大家的預定和夢想後，內心默默下了某種決心。

第146集【謝謝阿羅拉!各自的啟程!!】，小智決定回到真新鎮，但卻無法對大家說出口…。同一時刻，火箭隊和謎擬Q牠們道別的時刻也近了…。