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自來也是個不折不扣的老色鬼，因此也鬧出不少笑話。雖然如此，鳴人還是從自來也身上學到了不少東西。

當鳴人在進行修練之時，大蛇丸的邪惡計劃也在手下的推動之下，不間斷的進行中，而得知兜就是內奸的疾風竟成了犧牲者…

小櫻帶花想去探望住院佐助卻遇到受重傷的小李，看著他強忍疼痛繼續修練，實在不了解男生為什麼總是愛逞強。

為了幫助鳴人能隨心所欲的控制體內的兩股查克拉，自來也打算用比較激烈的手段來達成目的，就是利用死亡的威脅…

在自來也的激勵之下，鳴人終於喚醒了內在的九尾查克拉，沒想到也因此把蟾蜍老大給召喚出來…

想盡辦法馴服蟾蜍老大的鳴人，因此住進醫院，沒想到卻和我愛羅對上了…

正式的選拔終於要開始了，但是一開始就面對日向寧次這位強敵，的確給鳴人造成了不小的壓力…

正式選拔仍然如期舉行，隨即展開的淘汰賽，是鳴人與寧次的對戰，不被看好的鳴人，一開始即有令人刮目相看的表現…

鳴人使出混身解數應戰，甚至還出拳擊中寧次，而寧次則是運用另一種絕對的防禦，擋住了鳴人的攻擊，並且更進一步地予以反擊…

於寧次封鎖了鳴人的64個穴道，佔盡了絕對優勢，也因此讓鳴人陷入苦戰，然而這種完全使不出查克拉的感覺，也喚醒了鳴人跟隨自來也修練時的記憶…

比賽即將開始，卻始終沒看到佐助的蹤影，本來第三代火影打算宣佈佐助棄權，卻在風影的極力爭取下，改為將佐助和我愛羅的比賽延後…

一開始鹿丸的表現並不出色，但是後來則是漸入佳境，甚至還帶動起整個現場的氣氛，只不過令人料想不到的，就是鹿丸竟然在要嬴得比賽的同時，宣佈棄權。

期待已久的壓軸好戲－佐助對我愛羅，就在等候時間就要結束時，佐助終於出現了。但是，此時的我愛羅也顯露出非比尋常的表情…

受大家矚目的佐助與我愛羅的壓軸戰終於開打，雖然佐助一開始就以飛快的體術技驚全場，但是面對異於常人的我愛羅，佐助到底該如何因應？

佐助竟使出卡卡西的獨創招式一千鳥，也就是雷切，也因此讓重未受過傷的我愛羅受傷，然而大蛇丸的手下也在此時下達了計劃啟始的暗號…

隨著比賽告一段落，大蛇丸的瓦解木葉計劃也就此展開，雖然音與砂忍者村都已在事前做好準備，但卻因為我愛羅的暴走，使得砂忍者村無法動用最後王牌…

鳴人與鹿丸在小櫻解開幻術後，在卡卡西簡單地交待下，立刻前往執行首次的Ａ級任務。他們即將面臨的是前所未有的全新考驗！

接下了卡卡西交辦的任務後，鳴人等三人和小狗帕克隨即展開追蹤佐助的Ａ級任務，沒想到察覺到此事的兜，也派出了九名音忍追擊…

面對了大蛇丸用穢土轉生召喚來的第一代與第二代火影，第三代展現出寶刀未老的氣勢，也因此讓暗部隊長們目睹了一場精采地火影級的忍術大戰。

當第三代火影看到眼前的大蛇丸，不禁回想起過去那段放大蛇丸一條生路的回憶，雖然悔不當初，但是火影也下定決心，要從大蛇丸手中保護木葉忍者村…

為了從大蛇丸的手中保護木葉忍者村，第三代火影不惜施展必須用生命交換的忍術，眼看似乎快被限制的大蛇丸竟還能施展忍術，猿飛到底該如何因應呢？

我愛羅此時已變身成怪物，眼看沒什麼勝算的佐助，本打算等待志乃過來支援時，再做了結。然而志乃雖然是技高一籌，但是卻也因為中毒而不支倒地。

變身後的我愛羅，似乎有再生能力似的，就算佐助施展千鳥確實地給我愛羅痛擊，但卻都只是暫時性的傷害，被激怒的我愛羅則是打算給佐助最後一擊。

我愛羅雖然變身成怪物，卻也因為不穩定的情緒，讓他不斷地回想起過去種種的片段，尤其當想起令他痛不欲生的就是一起長大的夜叉丸…

在我愛羅的回憶中，一直都是孤單的一個人，即使是自己最相信的夜叉丸，其實也是對自己懷恨在心，這個打擊更讓我愛羅陷入了孤單的深淵…

危急之中，鳴人回想起從前白曾經說過的話，因此表現出前所未有的修煉成果，另一方面我愛羅也變身成為完全體，精采的戰鬥就此展開！

第三代火影為了從大蛇丸的手中保護木葉忍者村，選擇用自己的生命與死神交換，最後雖然沒辦法取大蛇丸的性命，還是用盡全力封印住大蛇丸的雙手…

鳴人用盡全力終於打敗我愛羅，也順利救出小櫻，此外，木葉忍者村在辦完了第三代火影的喪禮之後，大家強忍住悲傷，振作起精神繼續為從建木葉忍者村而努力…

離鄉多年的鼬，在濃濃的晨霧中和鬼鮫一起回到木葉忍者村，阿斯瑪和紅沒多久就追到鼬與鬼鮫，只不過鼬與鬼鮫的實力實在超乎阿斯瑪和紅的想像…

在寫輪眼對寫輪眼的衝擊之下，還是擁有正統血繼限界的鼬，功力佔上風。眼看到卡卡西就快被鼬折磨得不成人形時，還好阿凱及時出現…

鼬利用自來也的弱點，使出美人計引誘他，讓鳴人落單好下手。然而佐助在無意之中得知鼬已回來的事實，便火速趕往鳴人與自來也落腳的市集…

鼬支開自來也之後，便找上了鳴人，後來就在鬼鮫打算斷掉鳴人一隻腳的時候，佐助出現了，往日不堪回首的那斷記憶，也在此時一一甦醒…

雖然佐助用盡了全力，仍然不是鼬的對手，一直到後自來也眼看著佐助快被折磨得不成人形時，終於使出至今尚無人能破解的忍術…

自來也和鳴人把佐助託付給阿凱之後，便正式踏上尋找綱手的旅程，雖然自來也並不認為可以馬上找到綱手，不過卻答應鳴人會在旅行的途中指導鳴人修練…

自來也很快地就開始指導鳴人修練，一開始要鳴人從弄破水球，等成功之後才會再繼續第二階段，但是看以簡單的修練，卻讓鳴人花了好久時間…

鳴人通過了第一階段的修練，但還有第二段階等著他去突破，雖然在修練過程中遇到瓶項無法突破，甚至還因此反省過去的種種荒唐行為…

大蛇丸終於找到綱手，也很明日地告知來意，更不避諱將自己親手殺死猿飛的事告訴綱手，雖然如此大蛇丸還是利用誘人的交換條件…

自來也帶著鳴人踏上尋找綱手的旅程，終於劃下句點，因為他們已找到綱手，只不過綱手表明自己沒有擔任火影的意願，甚至還直說只有笨蛋才會當火影…

由於鳴人對綱手接任第五代火影一事非常不服氣，甚至公然挑釁，綱手也坦率地接受鳴人的單挑，甚至還以第一代火影的貴重首飾當賭注…

鳴人為了和綱手的打賭，日以繼夜不斷進行修煉，眼看著打賭的日期就快到了，卻還是沒有將螺旋丸真正練成功…

綱手雖然準時赴約，實際上卻是想殺了大蛇丸，雖然她是那麼地想見到她所愛的兩個男人，但她也了悟到凡是有形的東西都會凋零的道理…

自來也等人及時趕到，剛好替綱手解圍，兩方的對戰一觸即發。大蛇丸和兜挑明了瞧不起自來也和鳴人。

因為鳴人成功地發動了螺旋丸，此舉讓大蛇丸決定要殺了鳴人，沒想到綱手卻用自己的身體保護鳴人，甚至克服了血液恐懼症…

由於鳴人的勇氣與毅力，喚醒了綱手對兩個心愛男人的夢想的記憶，也因此讓綱手為了保護鳴人與木葉忍者村…

在綱手的提議下，大家在回木葉忍者村之前，前往一處溫泉鄉泡溫泉，沒想到竟然在那裡遇到來向綱手討債的人…

手終於回到木葉忍者村，而村子裡的忍者們也都忙著第五代火影的就任事宜，此外，在綱手的治療下，佐助和卡卡西很快地就恢復了。

木葉丸因為無法接受第三代火影爺爺已逝，必須由綱手接任第五代火影的事實而鬧彆扭，鳴人自告奮勇的表明自己可以解決，沒想到吃了閉門羹…

雖然小李是努力型的天才，但是面對身體上的障礙，可能再怎麼努力都不會有結果，後來在阿凱老師的鼓勵之下，終於決定接受綱手的提議進行手術…

鳴人突發奇想，想探索卡卡西面具下的真相，於是邀請小櫻和佐助一起參與，沒想到在追蹤的過程中，遇到三個過去曾和卡卡西有過節的忍者…

在綱手的交待之下，鳴人、小櫻和佐助三人，立刻啟程前往茶之國，執行保護茶之國老大山葵次郎長所推派的參賽者－森乃伊馱天的任務…

鳴人他們接下次郎長委託的任務後，便開始進行保護參加比賽的伊馱天。雖然鳴人他們數次幫助伊馱天，但是對忍者心存戒心的伊馱天，似乎都不怎麼領情…

在鳴人他們的幫助之下，伊馱天終於脫離雨忍們的糾纏抵達岸邊，但沒想到綠青葵早就在岸邊等候伊馱天上岸…。