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高中生夜神月撿到了一本由死神掉落、擁有「名字被寫在上面的人就會死」這種恐怖力量的「死亡筆記本」。

為了將世界改變成沒有罪惡的理想世界，月沒有停止在筆記本上寫下名字。

在以總一郎為首的搜查小組進行情報分析時，L提出奇樂可能是擁有自我正義感的學生。

無論如何都想獲知跟蹤者姓名並將其抹殺的月，計畫先掌握死亡筆記本的魔力。

月得知了FBI調查官雷的名字，處於隨時能取其性命的立場。但他認為若立即動手會引起懷疑，於是錯開了殺害雷的時間。在取得FBI相關人員情報前，一切都還不遲。

L邀請總一郎等5名搜查官進入飯店房間，解釋了奇樂的思考模式後，將焦點轉向潛入日本的FBI調查官。

月擔心女子擁有的情報傳到搜查本部，為了滅口立即在筆記本寫下女子的名字，但過了40秒女子卻毫無異狀，月意識到女子使用的是偽名。

L分析了潛入日本的FBI調查官死前的情報，從瀕死的雷拼命想看著離去電車內部的情況，L推理奇樂當時可能就在車廂內。

在夜神家與北村家裝設監視器與竊聽器後，奇樂的殺人行為依然持續，因此L向搜查本部宣布拆除兩家的設備。

若是好勝的奇樂，一定會追求「勝利」——。由於月是奇樂的可能性很高，進入月的大學的L為了加深情誼，向月挑戰網球。

當櫻花電視台播放自稱為「奇樂」的人寄來的錄影帶時，奇樂預告的人選就在現場直播中相繼死去。

在警察發表不協助奇樂的意向後，奇樂宣告將取走指揮官L性命的隔天——L決定在隱瞞第二奇樂可能性的情況下邀請月協助搜查。

正當月盤算著要比L更早抓住第二奇樂時，櫻花電視台收到了一張第二奇樂寄來的日記。日記中隱藏著只有真奇樂才能理解的暗號，邀請雙方互相展示筆記本

面對來到家中的海砂要求見死神，月為了贏得信任，讓海砂觸碰自己的筆記本，使她見到了路克。

雷姆表示只要帶他到L所在地就能立刻動手，月則表示需要仔細考慮殺害的時間與方式，約定明天再給回覆。為了不被警察竊聽，月借用了海砂多部手機中的一支作為聯絡工具。

由於海砂放棄了死亡筆記本的所有權，同時成為兩本筆記本持有者的月，隨即放棄了海砂原本持有的那本所有權，將其歸還給雷姆。

監禁第50天——自從奇樂恢復制裁已過了一個多月，相澤對於L遲遲不釋放月與海砂感到焦躁，質疑L是否因為不想承認「月＝奇樂」的推理錯誤才拒絕放人。

搜查本部搬進L建設的大樓數日後——曾斷定月就是奇樂的L，從監禁兩人的表現推測「奇樂的力量可能會轉移」。但如果奇樂能操縱他人殺害犯罪者，即便自己賭上性命搜查，也可能抓不到真兇，L顯得意志消沉。

松田以經紀人身分陪同海砂前往電視劇外景地，發現附近的一棟大樓正是搜查本部盯上的「四葉集團東京總部」。松田一直在意自己是隊伍中唯一沒建功的人，為了立功竟擅自潛入四葉集團內部。

搜查本部成功竊聽到四葉集團決定「誰何時該死」的會議，對高層們草菅人命的冷酷感到愕然。