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第1話【漂泊歲月】，大都市「儒來」因為失落儒來事件，一夜之間變成天坑。被當作主謀，以史無前例的 600 億 $$懸賞金遭到通緝的威席．史坦畢特，在事件過後就銷聲匿跡。兩年半後，梅麗魯成為一名可靠的記者，她和後輩米莉．湯普森一起追查席的下落，感覺從半年前開始再度發生的 PLANT連環搶劫事件背後，有密利歐．奈布茲的影子，進而展開調查。此時，傳來地球巨大移民艦隊接近的消息，居民們全都陷入歡喜。

第2話【不可原諒】，約 150 年前，發生史稱「大墜落」的宇宙移民艦隊墜落事件後，威席青年時期住過的移民船 3 號艦「家園」，突然遭到不明人士攻擊，一下子就被控制。住在家園的少女潔西卡，帶著夥伴們託付她的使命去找威席，她循著裝在威席義肢裡的追蹤器，在儒來郊外的鎮上遇見一名叫霍巴多的男人。他正保護著一名失憶，眼神空洞，名叫艾利克斯的青年。

第3話【勿忘你終有一死】，梅麗魯她們掌握目擊情報，得知在失落儒來事件後，就行蹤成謎的威席下落，與奇蹟般重逢的尼古拉．D．伍夫伍德一起，去家園尋找威席。同一時間，威席為了和潔西卡一起解救夥伴，來到陷入困境的家園。他們在那裡遇到奈布茲派來的刺客，以詭異力量攻擊他們的操偶師雷奧諾夫。

第4話【有序到混亂】，伍夫伍德、梅麗魯和米莉加入後，威席在家園度過一段短暫又安穩的時光。另一邊，密利歐．奈布茲在失落儒來失去了肉體，康納德等人企圖讓他復活，利用失落科技打造的飛行船「方舟」，不斷搶劫PLANT和進行大規模屠。持續讓大地染血的他們，為了搶走家園裡的大量PLANT，正準備派出新的刺客。

第5話【多麼美好的世界】，在方舟攻擊家園之前，吹號手米多巴雷來抓威席。尼古拉斯主動代替尚未調整好狀態的威席去對付吹號手。一邊是出於恐懼繼續服從奈布茲的吹號手，另一邊是憑自己的意志擺脫奈布茲支配的尼古拉斯，尼古拉斯試著勸說對方，但沒有奏效，吹號手對尼古拉斯發動音速攻擊，雙方展開激戰。

第6話【黎明前是最黑暗的時刻】，隨著傾瀉而出的飛彈，方舟對家園的攻擊正式拉開序幕，保護和隱藏家園的風暴防護罩，也被曾隸屬於移民艦隊研究機構的康納德破壞，讓雷卡特．布魯沙馬斯等人成功入侵。雷卡特在失落科技的強化下對威席發動猛攻，使他陷入苦戰。接著，復活之時終於到來。

第7話【絕境】，威席被方舟俘虜後，已經過了5個月，各地依然持續發生PLANT搶劫事件。人們活在恐懼中，但仍懷著唯一的希望，等待地球移民艦隊的到來。以家園為據點，一邊進行採訪一邊持續尋找威席的梅麗魯和米莉，對動盪的局勢感到不安。另一方面，在方舟上對峙的威席和奈布茲，開始談起舊友泰絲拉的記憶。

第8話【再見 吾友】，尼古拉斯趁雷卡特露出破綻時，成功救出威席。兩人試圖逃離方舟，原以為已經死去的尼古拉斯小弟利維歐卻現身了。喜悅只持續了片刻，利維歐就自稱是致命三重制裁者．拉茲羅，開始攻擊兩人。面對預料之外的發展，尼古拉斯難掩驚慌，但還是設法擺脫了猛烈的攻擊，抵達曾和利維歐一起待過的孤兒院。將受了重傷的威席安置在孤兒院後，尼古拉斯與追來的拉茲羅對峙，壯烈的戰鬥就此揭開序幕。

第9話【重聚】，為了躲避方舟的侵略，許多難民聚集到荒漠之星少數的大都市奧克托萬。，然而這卻是奈布茲可怕計劃的一部分，他打算讓來自地球的移民艦隊墜落在奧克托萬，一舉殲滅人類。為了不讓大墜落和失落儒來那樣的慘劇再次發生，只能在此阻止奈布茲。威席一行人朝著最終決戰，開始進行準備。

第10話【殉道者】，奈布茲透過不斷與PLANT融合，逐漸獲得異形的姿態和壓倒性的力量，威席利用與PLANT共鳴，將方舟引誘到某處，那裡是他們兄弟降臨到荒漠之星的最初地點。在那裡守候的威席、尼古拉斯和利維歐，迎接雷卡特和九命的猛烈攻擊。面對擁有壓倒性力量的雷卡特，威席被迫做出動搖自己信念的重大抉擇。