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第1話【第一次的礦物採集】，最喜歡亮晶晶東西的女高中生谷川瑠璃有天對水晶墜鏈一見鍾情。心想著說不定能靠自己採到水晶的瑠璃馬上前往山裡，在山中遇見專攻礦物學的研究生荒砥凪，因緣際會下跟她一起出發去採礦。瑠璃被大自然所震懾，立刻迷上了礦物採集的樂趣。這一天，瑠璃與凪一起來到河岸尋找石榴石。

第2話【金色的價值】，這天瑠璃和凪為了採集金子一起來到山裡。當瑠璃看到岩石斷面閃爍著金色光芒頓時興奮不已，但凪卻告訴她那不是黃金而是黃鐵礦，害她瞬間失望。然而在發現一塊形狀奇特的黃鐵礦之後，使得露璃開始思考金錢之外的價值。幾天後兩人前往河邊採集砂金卻因為遭遇大雨，面臨不得不停止採集的危機……

第3話【殘留的恆星】，凪為了讓瑠璃看有關黃鐵礦的論文，把瑠璃叫到大學的研究室。瑠璃在那第一次遇見跟凪一樣就讀礦物研究所的伊萬里。瑠璃在幫忙掃除時找到標示神秘礦山的舊地圖，興奮地大叫到「感覺好像會有寶藏耶！」於是三人以地圖為線索前往礦山，在那裡發現……？

第4話【解讀砂子】，琉璃和凪使用大學實驗室的顯微鏡，從河川採集的砂子中尋找藍寶石。這天兩人的成果只找到一小粒，便決定改日繼續挑戰。琉璃覺得「蒐集這些小碎片要弄到什麼時候」、一心想直接去山裡尋找藍寶石，凪見狀勸誡她調查河砂才是找出藍寶石產地的捷徑。於是兩人為了找出藍寶石真正的產地，繼續專心調查河砂。

第5話【看得見與看不見的世界】，琉璃和凪使用大學實驗室的顯微鏡，從河川採集的砂子中尋找藍寶石。這天兩人的成果只找到一小粒，便決定改日繼續挑戰。琉璃覺得「蒐集這些小碎片要弄到什麼時候」、一心想直接去山裡尋找藍寶石，凪見狀勸誡她調查河砂才是找出藍寶石產地的捷徑。於是兩人為了找出藍寶石真正的產地，繼續專心調查河砂。

第6話【凝視著那抹藍】，成功鎖定藍寶石產地可能地點的琉璃與凪和伊萬里一起前往山中。然而預定要調查的地方堆滿了枯葉，於是轉而調查河砂。在大學實驗室調查河砂的琉璃發現自己的筆記可能有錯，再度進行確認，這才發現原來漏掉了一處沒有紀錄到。

第7話【海岸邊的回收工廠】，琉璃的同班同學瀨戶從小就喜歡石頭，但發現沒有人能理解這興趣倍受打擊，從此緊閉心門。這天琉璃考完試和同學一起到海邊玩時在海裡撿到漂亮的石頭，拿回研究室檢查後發現不是石頭而是玻璃，儘管如此，琉璃仍向伊萬里提議再次去海邊採集，瀨戶也因緣際會地加入採集的行列。

第8話【黃昏色的輓歌】，琉璃決定和瀨戶一起做暑假的自由研究。過程中瀨戶找到橘色的礦物，但踩著河床時腳滑不小心把礦物弄丟了。之後琉璃去找凪商量，並決定大家一起去山裡協助伊萬里進行螢石調查。在螢石調查時談到能從水質尋找礦物產地，於是一行人決定透過水質調查尋找瀨戶弄丟的那種礦石。

第9話【190萬噸的時空膠囊】，琉璃和凪一起去採集蛋白石，但發現礦脈早就被挖空。瀨戶聽說之後，為沒能參加蛋白石採集而感到難過，琉璃便向她提議一起去淘砂金。她本來認為大雨後能採到許多砂金，想不到竟找到砂金以外的許多礦物而感到疑惑。問過凪才知道，原來豪雨說不定造成新產地出現，一行人便決定前往調查。

最喜歡閃亮亮事物的女高中生．谷川瑠璃有天聽說「可以靠自己採到水晶！」而為了尋找水晶前往山中。她在山裡遇見專攻礦物學的女研究生．荒砥凪，於是兩人決定一同採集礦物。有時為了尋找水晶走在山中的道路，有時為了撿拾石榴石浸在溪水中，有時又為了尋找未知的礦物而窺望顯微鏡──瑠璃在凪的引導下，一頭栽進了礦物採集的世界。「就算是我應該也能採得到才對。」這正是任誰都曾有過的夢想。正宗科學冒險故事就要開始了！