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第230集【懷古飯店的神秘事件】，柯南一行人在單軌電車“一番町站”要搭車前往海豚樂園之際結識相約敘舊的三名大學同學，有美女同行毛利便跟著她們一同來到另一位同學：藤村直美下榻的海豚樂園附屬飯店，卻發現她已遭人殺害，兇手竟然是...

第231集【復仇海灘（上）】，柯南與毛利一行人因為車子故障停在路邊結識了東京橘法律事務所的橘大律師，因此暫時借住他家，誰知隔天橘律師竟然因出海釣魚溺斃身亡，經種種現象發現他還是死於他殺，兇手到底是誰？又有何目的？

第232集【復仇海灘（下）】，柯南在調查橘律師釣魚的小船之後發現可疑的痕跡和莫名遺失的船錨。之後衫村小姐說出熊田達也事情的真相。在看到約翰的狗屋的牌子之後柯南發現了兇手的身份。

第233集【目暮警官塵封在內心裡的秘密（上）】，連續有三名女子遭到歹徒攻擊，警方疑為同一人所為，便打算請佐藤警官偽裝引誘犯人上勾誰知第一個卻引誘到毛利，將整件事情表露出來，此時小蘭正巧在百貨公司地下停車場發現一名受害女性，尖叫出聲…

第234集【目暮警官塵封在內心裡的秘密（下）】，經過柯南的詳細分析之後得知兇手行兇的對象都是腳上穿著厚底鞋，自行開車的年輕女孩，最後警方變將目標鎖定在杯戶百貨公司的警衛定金身上，但定金卻已展開下一步的行動，企圖對園子下手，她會有危險嗎？

第235集【名偵探齊聚一堂、工藤新一VS怪盜基德（四之一）】，怪盜基德揚言要盜取江古田市的一座古老鐘塔，引起警方大肆戒備，工藤新一也與目暮警官前往支援，怪盜基德以為一切都在他的掌握之中誰知他的一切行動都在新一的算計之內，就在他即將盜取鐘塔短針上的寶石之際...

第236集【名偵探齊聚一堂、工藤新一VS怪盜基德（四之二）】，其實怪盜基德之所以會放出風聲說要盜取江古田鎮的古老鐘塔，其實是為了從鐘塔的所有人手中奪取鐘塔，暫時交由警方保管，才能阻止鐘塔被牽至主題樂園；毛利接獲一封邀請函，函中未屬名寄件人，卻隨函覆上一張兩百萬的支票，表示邀請他到府上晚餐，這筆龐大的金額自然促使毛利帶著女兒與柯南上路，但他們此行會有何離奇的遭遇呢？

第237集【名偵探齊聚一堂、工藤新一VS怪盜基德（四之三）】，毛利到了黃昏別館後才發現原來有六名偵探都受邀參加這場晚餐會，而在主人現身後，竟發現他是一個戴著頭套的假人，而主人的目的竟是要他們找出寶藏才肯告知脫離別館的方法，而美食家偵探大上竟在吃過飯後立刻猝死，其他人會有生命的危險嗎？

第238集【名偵探齊聚一堂、工藤新一VS怪盜基德（四之四）】，柯南與大家聯手演了一齣死亡鬧劇，為的是讓千間女士自己招供，誰知在他將一個金鐘拆下來之後，卻引發整座黃昏別館的牆壁崩塌，露出其中的黃金，原來黃昏別館整個就是一座黃金城堡。

第239集【滿口謊言的委託人（上）】，一位長相脫俗的中年婦女─池波女士委託毛利幫她尋人，為的是要回一張30年前拍的舊照片，但在毛利一行人找到此人家中時，卻發現他陳屍客廳，而柯南又發覺池波處處在說謊，兇手到底是誰？池波說謊的用意又是什麼？

第240集【滿口謊言的委託人（下）】，抱著對池波女士的懷疑，柯南發現柴田先生的屍體透露出許多疑點與證據，藉此直指兇手就是柴田太太，最後竟然還發現池波女士就是老友服部平次的母親...跌破眾人眼鏡。

第241集【人魚失蹤記（事件篇）】，毛利一行人在服部平次的邀請下來到為在福井縣海上的一個小島─美國島找尋委託人，因他收到一封奇怪的委託書表示人魚不見了，誰知到了島上卻陸續有人遇害，難道此事真與島上的人魚傳說和‘儒艮之箭’有關嗎？

第242集【人魚失蹤記（推理篇）】，繼壽美，奈緒子相繼遇害之後，君惠竟也被警方檢驗出於倉庫燒成焦屍，沙織到現在仍然下落不明，柯南與服部平次分頭進行調查，誰知就在服部與和葉隨同福井縣的警方找山裡搜查門協先生時，發生和葉墜崖的意外...

第243集【人魚失蹤記（解決篇）】，原來美國島上一連串的命案都是美國神社的女巫君惠所為，其實島上根本沒有什麼長壽婆，自從君惠的曾祖母死後，一直由她母親假扮，但三年前她卻因為紗織等人沒抽中儒艮之箭懷恨在心，將她燒死在倉庫中，君惠得知後才會新生報復...

第244集【生意興隆的秘密】，步美班上的一位同學倫太郎因為家中突然來了一位奇怪的叔叔後，店裡的生意就開始日漸好轉一事感到非常不對勁，便求助於少年偵探隊經過調查，發現這位叔叔竟然就是五年前盜取米花珠寶店一批價值三億元珠寶的珠寶大盜…

第245集【戰鬥遊戲的陷阱（上）】，柯南隨著園子，小蘭一起到遊樂中心玩，意外發現小蘭學校的美籍英文老師─茱蒂，就在他們為老師高超的技巧讚嘆時，身旁的戰鬥遊戲機上竟然發生了一起命案，兇手到底是誰？動機為何？用的又是什麼手法？

第246集【戰鬥遊戲的陷阱（下）】，志水高保看到自己妹妹為了替男友尾藤償還賭債辛苦工作一個月不吃不喝，竟然差點因營養失調導致維他命E缺乏造成失明，尾藤又不願離開他妹妹，就因此心生殺機，對尾藤下毒...

第247集【暗藏殺機的陶藝教室（上）】，小蘭跟著園子一起到陶藝教室為新一製作茶杯，柯南也跟著到了陶藝教室，誰知沒過多久卻發縣陶藝老師美濃宗之的女婿菊代陳屍倉庫的櫃子中，兇手顯然就是美濃宗之，但一切線索都對他的助手菊代小姐非常不利，柯南會如何揭發他的罪行呢？

第248集【暗藏殺機的陶藝教室（下）】，陶藝老師美濃宗之的女婿被發現陳屍在倉庫之中，乍看之下嫌疑最大的人是與他有感情的菊代小姐，但柯南立刻看出兇手是宗之本人、問題在於如何找出他的行兇手法與證據...

第249集【神秘乘客（上）】，阿笠博士打算帶著一群小孩去滑雪，就在搭上前往滑雪場的公車途中，卻碰到有人挾持公車，為的是要求警方釋放一個月前珠寶搶案的主嫌矢島邦男，而公車後座又有劫匪的同夥，柯南根本無法探查詳情，他該怎麼辦？

第250集【神秘乘客（下）】，經過仔細的觀察，柯南終於發現兩名劫匪在車上的另外一名同夥，以及他們計劃脫逃的方式，就在他揭穿了劫匪的計劃，用計讓司機緊急煞車的時候，確意外啟動了劫匪同夥引爆炸彈的裝置，而灰原竟想藉此了此一生...

第251集【公寓墜樓事件】，毛利受託調查一件遭人恐嚇的案件，誰知在他要造訪委託人的時候，這名委託人吉村卻當著他的面墜樓身亡，這是一宗意外還是他殺？柯南又該如何揭發這名兇手...

第252集【未消失的證據（上）】，阿笠博士帶著柯南一行人來到一個愛狗的加納先生家，他因為工作必須常住英國，父母又要到鄉下養老，便想將屋中物品轉送親友，但到此後不久竟發現加納家的一隻狗：道爾竟然失蹤了，且極可能是遭人藏匿，柯南該如何找到道爾，將歹徒揪出來呢？

第253集【未消失的證據（下）】，在發現了幾點蛛絲馬跡之後，柯南終於知道，將道爾藏起來的人員來是綱島先生，而且他的目的不在抓走道爾，而是取走鑲在道爾項圈上的寶石，但這與和室裡的掛鐘和客廳裡的音響又扯上了什麼關係呢？

第254集【地下酒窖密室】，柯南與小蘭隨著毛利一起接受日下先生之邀到他家中品酒，毛利為了能品嚐到罕見的世界級名酒興奮不已，誰知沒過多久卻發現日下先生死在自己的地下酒窖裡，兇手到底是誰？又是用何種手法取人性命的呢？

第255集【南紀白濱神秘之旅（上）】，毛利帶著小蘭與柯南來到南紀白濱渡假，在此巧遇一群大學生，其中有三人是來此寫生，但從幾人的交談中卻可感覺到暗潮洶湧的態勢，就在柯南第二天要前往冒險世界的途中，竟然強烈感覺到受人監視的氛圍，之後便傳出真紀遇害的消息，兇手到底是誰？又是如何行兇的？

第256集【南紀白濱神秘之旅（下）】，看似強盜殺人卻又錯綜複雜的命案，原來是個案外案，新庄真紀原本計劃殺害搶走自己男友的窗華，誰知卻被自己信任的同夥：加奈子將計就計，利用她所計劃的不在場證明將她殺害...

第257集【大阪3K事件（上）】，三名體育名人在大阪合開餐廳，邀請到各界名流與會，柯南與毛利一行三人因為服部平次的的關係得以出席，親眼見到自己仰慕已久的足球選手雷，誰知一名曾經揭發他們醜聞的報社記者竟然死在樓上的飯店中，兇手到底是誰？會是他們三人之中的一人嗎？

第258集【大阪3K事件（下）】，報社記者在3K餐廳的老闆想給來賓一個驚喜，以飯店客房的燈光秀出K的字樣時，遭人槍殺身亡，乍看之下應邀的來賓似乎都有嫌疑，柯南也本能的想要為他的偶像：雷脫罪，誰知在一連串的查證中，反而一一揪出他的罪狀...

第259集【新幹線護送事件（上）】，高木警官與佐藤警官押解一名毒販從大阪坐新幹線前往東京的途中，該名嫌犯竟然在廁所裡面拿刀自盡，而在案發之後不久，原本刺進嫌犯腹中的刀子竟然抽了出來，此舉是嫌犯自己所為，還是另有其人呢？

第260集【新幹線護送事件（下）】，新幹線列車上的廁所內這次成了凶案的現場，大家都異常震驚，甚至判斷是宗自殺案件，但柯南卻發現命案現場極為不合常理，再度以毛利叔叔之名破解迷團，糾舉出真正的兇手與他的行兇手法，令兇手啞口無言。

第261集【元太的災難】，元太曾經看過最近老是在街上出沒的強盜犯，卻記不得是在那裡看到的，但是這名強盜犯卻來電恐嚇元太不得聲張，否則便殺了他和他全家，元太心理上受到極大的震撼，飯也吃不好，柯南等人也因此揭發了這整件危及到元太性命安全的事件…

第262集【毛利小五郎鬧雙胞（上）】，毛利小五郎受葵屋旅館老闆之託，到旅館去調查一名四年前在頭神森林裡自殺的紅衣男子一案，沒想到竟然有人先他一步以他之名住進了旅館，毛利小五郎將計就計，計劃在他進行推理的時候一舉戳破他的假面具，沒想到這名冒牌貨竟然也上吊自殺了？這究竟是怎麼回事？是自殺還是他殺…謎團似乎越來越難解了

第263集【毛利小五郎鬧雙胞（下）】，柯南在冒充毛利小五郎的男人陳屍的房間內發現了線索之後，便將小五郎引到森林裡，再打電話給山村警官表示他將進行推理，而兇手也如柯南所料的來到森林裡面挖寶，自己承認了自己就是兇手的事實…

第264集【向日葵館的槍聲】，毛利小五郎受邀到一位名聲頗高的建築師家中調查他被人跟蹤恐嚇一事，毛利還拍胸脯保證在他從上海領完獎回來的時候，一切事情都會解決，沒想到這位金澤建築師當晚就死在家中，兇手是誰？誰又可能利用松樹上的獵槍開槍射人呢？

第265集【網中謎（上）】，阿笠博士帶著柯南等一行人來到海邊玩水，沒想到又與小蘭和園子碰到一起，在他們一行人到飯店的「東風樓」吃飯的時候，正巧碰上了白天曾發生了一點不愉快的幾名漁夫，得知他們約著要見面的荒卷先生沒來赴約，便一起到海邊去找他，沒想到荒卷竟然已經死在海邊了…

第266集【網中謎（下）】，小蘭、園子與三名漁夫和阿笠博士一行人到了海邊發現荒卷先生的屍體，柯南卻從種種不正常的現象找出他殺的證據，並且指稱三名漁夫當中的一人：下條先生就是殺人兇手，下條才娓娓道來他殺人的目的與用意…