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黑木拓哉及黑木優也為特別武器隊成員，在執行任務時發現一名神秘女子。 同時，無人知曉霧原直人及霧原直也在一處森林甦醒。

奇蹟米克在餐廳遇到一名女性。黑木兄弟和SWE潛入餐廳。就在此時，他們遇到了霧原兄弟...

直人和直也的家變成了空地。雙海翔子帶他們到去他們父親已廢棄的工廠。在那，他們遇見了調查連環謀殺案的拓哉和優也。

受傷的直人和直也被放政府組織“言論自由聯盟”所救，然後帶他們到一所再教育機構，目睹了俘虜被欺凌的情況。

在翔子的引領下，直人和直也從國家保安部隊總部救出正幸的母親。同時，SWE成員的超能力覺醒，並開始了控制超能力的訓練。

聯盟進行劫持電視節目直播的行動。直人被迫參與，因為直也被捉為人質。直也預見行動會失敗，並找出聯盟裡的叛徒。

直人和直也在他們曾經被隔離的研究所中甦醒。和御廚重逢後，他們知曉了外面世界情況背後的真相。

優也看到其父母的影像。他使用其閱讀能力在君枝的電腦上，嘗試讀取SWE網絡裡的機密資料。

霧原兄弟和四名SWE成員被奧原傳召。他揭露霧原兄弟和黑木兄弟的共存會毀滅世界。

通過正幸的超能力，直人和直也被瞬間移動到俄羅斯一個曾發現翔子的海岸。在那，他們知道御廚出現後，便被帶到一所設施。

翔子的超能力吧霧原和黑木兄弟瞬移到涉谷。裕也和直也尋找方法避免即將降臨的毀滅。拓也和直人發覺他們的弟弟正面臨危險。。。

世界毀滅開始了，本田無法消滅霧原和黑木兄弟。奧原把世界的命運交給兩對兄弟。