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在天丸區的新京市。趙氏財團董事長單車博士和百夫長集團的首領炎天，正在對普通市民進行演講，內容是關於x5事件對環境造成的破壞，和對未來的展望。單車博士對其所創設的趙氏科學學院所取得的實際成績進行了說明。並且，他堅信趙氏科學學院培養出來的孩子一定能夠肩負起進一步推動新京市的發展，構築人類的美好未來的重任。單車博士說完後，實況轉播中開始介紹趙氏科學學院的優秀學生們。在這之後，單車博士向大家報告了趙氏財團派出的環境觀測無人飛行器將定於本日返回新京市的消息。百夫長組織首領命令三人組奪取環境觀測無人飛行器中裝載著的數據。

三人組接受了百夫長組織首領新的命令後，計劃奪回數據。單車博士準備對之前收回的環境監測飛行機中的數據進行分析。三人組在一番周折後潛入了研究所。風鈴要去採訪單車博士。和風鈴一起的拜克收到了入侵警報，告辭趕往研究所。殊不知風鈴為了採訪單車博士也正趕往研究所。單車俠趕到研究所，在一番搏鬥後，三人組駕駛飛行器搶走了無人機研究室，單車俠窮追不捨。在單車俠的糾纏下，飛行器上的研究室掉落，博士趁著時機將研究室內重要的數據晶元取出。三人組拿著空的無人機回到基地，任務失敗。

三人組的飛行器損壞，為了修好飛行器，他們計劃搶奪收集館。三人組的行動驚動了員警，同樣得到消息的拜克認為這是員警的工作，對此並不積極，二寶批評了他。拜克執意要憑藉自己的力量騎行到現場，因為特殊的體質，體力不支倒下。單車博士隨即趕到，帶走了拜克。眼睜睜看著三人組逃走令拜克後悔不已。二寶表示不能理解拜克的行為，單車博士認為是因為拜克自尊心使然，並說明瞭自己選擇拜克作為單車俠的原因：單車博士曾經嘗試和單車俠試用型合體，並不成功。 身體孱弱的拜克在平時也不能和同學們進行正常的體育運動，反而被同學誤會是矯情。

三人組和單車俠遭遇，山虎阻攔單車俠，另外兩人逃跑，山虎成功達到目的後轉身逃跑，單車俠緊追不捨，並且無視二寶的勸說。二寶提醒拜克他的初衷，令拜克陷入和二寶初次合體的回憶：拜克在使用單車俠還不熟練的時候，曾經因為救一個小孩而損壞了單車俠，拜克對自己的行為感到抱歉，博士卻表揚拜克具有英雄潛質，收到激勵的拜克，表示自己會努力成為一個合格的英雄。回憶結束。拜克反省了自己的行為，通過與二寶的完美配合，最終打跑了三人組，使三人組盜竊引擎的計劃失敗。二寶通過這次任務勉強認可了拜克。

拜克在百夫長集團的社會課中觀看影像記錄，並從中得知：20年前出現過一場實驗事故，由神秘老人發明的月之X5裝置發生爆炸，並使原本就不理想的環境惡化了。於是人們建立了天丸城。大壯說他爺爺有一本記錄月之X5的日記流落在舊書店。拜克回去告訴了單車博士，這使得單車博士很感興趣。恰好三人組在舊書店搗亂。單車俠在和二寶一番爭執後終於出場。貝比用調虎離山之計將單車俠引離書店，並繼續尋找書本。此時單車博士來到了書店，並看中了一幅和月之X5有關的掛軸。炎天搶先一步將掛軸拿下，但最終被貝比得到手。

一邊單車俠正在追拿手持另一半掛軸的貝比，另一邊單車博士和炎天就月之X5的下落談話。博士和炎天來到風鈴家的餐館，炎天給博士看了一段關於單車博士父親神秘老人的錄像：錄像中的神秘老人認為月光X5是一個危險的失敗作。單車博士很驚訝。炎天要求單車博士告知月之X5的下落，單車博士以過於危險而拒絕透露資訊，炎天表示理解。風鈴想要採訪博士，無奈總是被叫去幫廚。單車俠在一番追逐後，終於得到了兩半掛軸，他和博士匯合，並將掛軸交給博士，卻被風鈴端上來的湯弄毀了。單車博士沒有責怪他們，他認為這樣能更好的保存月之X5的秘密。

三人組對於單車俠幾次三番的阻撓感到很憤怒，首領也對他們的執行效率感到失望，並警告了三人。首領下達了新命令，讓他們去收集單車博士的資訊。三人組心情沉重，並開始回憶過去的生活。山虎曾經是一名拳擊手，因為掀翻了拳擊臺而失去了自己的職業。而蘇曼曾經是一名程式師。另外一邊，風鈴對月之X5非常感興趣，並為此寫了新聞。蘇曼追蹤到了單車博士和單車俠的通訊資訊，並用單車俠的聲音給正在做實驗的博士發了一條假消息，將其引出來。另一邊，貝比在商場佈置假炸彈，將單車俠支開。

單車俠盤查完炸彈發現聯繫不上博士，便趕往研究室並發現了博士失蹤，然後根據那條虛假的消息尋找線索。三人組將博士綁架到飛行器中，蘇曼表示自己喜歡單車博士這種類型的男生，另外兩人震驚。在和單車博士的對話中，三人組得知單車博士正在研製簡易版X5。三人正在為了如何套博士的話而爭執時，單車俠潛入了飛行器，並就悄悄地就走了博士。發現博士不見的三人組駕駛飛行器追拿博士的飛車，卻被單車俠攔住，與單車俠發生激烈的戰鬥，單車俠不敵，最後在博士使用了飛車上的電子光束，兩人攜手打敗了三人組。三人組回到基地，首領對於這次收集到的資訊表示滿意。

怪盜X盜走了美術館內的古董紅酒龍心碗。博士和拜克收到了員警署長的求助，這個怪盜盜竊前會發出盜竊預告。員警署長將盜竊預告給博士二人檢查，二寶分析出通知書上的護手霜，判斷對方是一名女性。拜克懷疑怪盜是蘇曼，最後不了了之。第二天，風鈴表示對怪盜X很感興趣，要找機會採訪她。雲翎老師提醒她安全第一。怪盜X又發出了盜竊預告要盜取貴橄欖石。三人組也收到首領的命令，去盜取貴橄欖石。三人組在美術館外進行破壞活動，吸引警方的注意力，蘇曼喬裝成帶嬰婦女潛入美術館，並解決了警衛，並打傷了署長，貝比利用這時間盜取橄欖石。

風鈴對女怪盜高超的武藝十分崇拜。雲翎老師對此很不高興。拜克收到了消息，女怪盜X要開始盜竊翡翠女神。女怪盜X留言想要見到單車俠。拜克為此單算搜集翡翠女神的資料，在圖書館偶遇了雲翎老師，雲翎老師為拜克介紹了翡翠女神的資訊。三人組也得到了首領的新命令，偷出翡翠女神，並且首領承諾，珍貴的翡翠女神可以任由他們處置。三人在驚喜之餘堅定了偷取的信念。當天，單車俠來到美術館卻發現只有員警署長一個人。同時三人組也開著飛行器趕到了現場，蘇曼將單車俠和署長被關在柵欄裡。單車俠發現署長前幾天被蘇曼打傷的地方不見了，署長原來是女怪盜X假扮的。

學校將要舉辦自行車大賽，拜克對此沒什麼興趣，但是大壯卻對此感到很激動。大壯在放學之後不斷地練習騎車，自行車都被騎壞了。拜克幫他修理，大壯告訴拜克自己的理想，拜克想要説明他完成。同學們都嘲笑大壯。大壯不堪羞辱，跑了出去，在公園裡碰到了同樣失落的三人組。三人組用自己的經歷告訴大壯，不要因為自己的條件自卑，不要在意別人的看法，勇敢追逐夢想。跟在大壯身後的拜克對三人組的行為感到很困惑。大壯解開心結，打電話給拜克，讓他説明自己練習騎自行車。在練習中拜克發現三人組的行蹤，並藉口離開。

比賽當天，所有人都在進行現場。三人組趁機潛入博士家，貝比在上次摸清了博士家的防禦系統，這次來很輕鬆地就破解了所有防禦機制。就在他們大搖大擺地進入房間時，還是觸發了警報。博士收到消息，並擺脫拜克去看看。拜克趕到，將困住的三人組趕跑。貝比慌亂中掛在了飛船上，並在飛行中掉落在森林中。 比賽中的大壯看見，放棄了比賽，來救貝比。貝比讓他回去比賽。但是大壯執意要救貝比，並且在救的過程中受了傷。貝比將手上的大壯交給正在追擊飛行器的單車俠，自己回到了飛行器。 大壯受了傷，但是仍然堅持參加完比賽。

三人組和首領商量要查出單車俠的資訊，先發制人。 風鈴和拜克在放學後，遇到了悶悶不樂的擁軍，原來擁軍的夢想是當一名員警，而他爸爸員警署長卻不支援他的夢想。拜克收到了員警署遇襲的消息，並打算前往。無奈風鈴和擁軍無法甩掉，最後大家得到了員警署遇襲的消息，三人一同前往員警署。三人組的計劃是，山虎和貝比虛張聲勢，謊稱要炸毀警署，吸引所有人的注意，而蘇曼利用電腦調出監控，搜集單車俠的資訊。觀察單車俠在小巷子變身的攝像頭被驚嚇的野貓阻擋了，結果還是沒能得到單車俠的資訊。

三人組來到了單車俠變身的小巷調查單車俠的線索，但是一無所獲。首領告訴他們警署的保衛系統已經加固了，不過還可以通過入侵趙氏財團的系統來獲取資訊，三人組前往博士家。擁軍敏銳的直覺察覺出上次的事件可能有蹊蹺，並執意要親自告訴單車博士，證明自己有做一個員警的潛質。炎天、博士和署長三人正在就昨天的時間商量。拜克擁軍等人來到博士家，發現警報系統失靈，原來被是反派三人組破壞了。單車俠偷偷變身，並尋找三人組。單車俠因為顧及會破壞實驗室里的重要資源，而束手束腳。發現入侵的署長也起身，擁軍也跟了上去。

學校精選學生會會長，李凌菲一心想要當選。雲嶺老師說當選的人就能夠獲得一枚鑲有藍寶石的徽章。從此，李凌菲就開始了她的拉票行動，逢人就拉。李凌菲告訴拜克自己當學生會長只是為了當市長打基礎，這一點讓拜克咋舌。拜克看到照片上的藍寶石覺得很像X5留了一個心眼。果然在藍寶石徽章送來當天，運輸徽章的車遭遇了怪盜X的襲擊。李凌菲對於藍寶石徽章有著瘋狂的執念，不顧危險地跑上前保護徽章。拜克變身成為單車俠和怪盜X發生爭鬥。 怪盜X靈活的身法讓單車俠奈她不何。就在怪盜X幾乎要得手時，她突發身體不適，放棄了寶石，離開了。

首領懷疑學校的藍寶石徽章是X5，為了搞清楚，他命令三人組將寶石勳章弄到手，三人組於是討論之後決定在學生會長就任典禮上突襲，搶奪徽章。學校方面，大家將李凌菲視作英雄，李凌菲認為這樣對她的選戰大有説明，所以就預設了這種說法，但是風鈴卻不以為然，因為她知道真正的英雄是單車俠。選舉當天，在博士的要求下，學校將儀式變為室內轉播形式，三人組想通過突襲學生聚集的地方，從而造成混亂趁機進行偷盜的計劃，完全失敗。早就埋伏好的單車俠衝上舞臺，和三人組展開徽章的保衛戰。李凌菲在突發狀況中，第一時間維護好同學的秩序。

李凌菲因為救一隻貓咪而被車撞了。拜克秘密變身為單車俠，送李凌菲去秦莫醫生的醫院。雲翎也來到醫院。李凌菲接受手術，但是她失血過多，而醫院的備用血不夠。 風鈴和秦醫生都通過自己的方式，尋求説明。秦醫生得到了血液來源，但是時間可能不夠，拜克變身成為單車俠趕往提供血液的地方。秦醫生聯繫了單車博士，讓他按照十年前的一個案例，再救一次這個小女孩。但是這次單車博士拒絕了他。三人組收到首領的命令去調查醫院發生的事件，三人組瞭解到事件的經過，發現山虎的血型剛好合適，山虎秘密地為李凌菲獻了血，然後默默地離開了。

李凌菲傷勢恢復得差不多了，但是精神還沒有恢復過來，大家想了很多辦法讓她恢復活力，希望能夠讓她開心一點，但是似乎都沒有什麼用。雲翎看到了這一切，喚起了她的回憶：在十年前雲翎也曾經和李凌菲一樣被抄近路的大貨車給撞到，同樣被送到了秦莫醫生那裡，秦醫生對於如此嚴重的情況束手無策。這是單車博士出現，並提供了一片ic晶元，說這樣就可以救雲翎，秦莫接納了他的意見，並成功挽救了雲翎的生命。 回憶結束。首領讓三人組去調查李凌菲。 三人在潛入醫院時遇見了風鈴和拜克。三人逃走，拜克秘密變身追去。三人組和拜克在屋頂上打鬥了起來。

博士的無人機從廢墟中帶回來的觀測影像顯示，無人區有很大的可能存在生命體。 拜克懷疑是神秘老人。無論如何這都意義非凡，穩妥起見，博士還是決定派出機器人收集更多情報。炎天崔次表示大力支援，他積極地提供了物資和無人機，博士對此表示感謝。 首領交代三人組跟隨無人機前往廢墟，調查神秘老人。 在無人機出發當天，風鈴為了能出個大新聞，悄悄地潛入了無人機機艙。 在飛行的過程中因為劇烈的晃動，風鈴在無人機內撞暈了。 大家正在尋找風鈴，最後博士發現了風鈴上了無人機，並計劃調回無人機，但是炎天卻不肯提供説明，博士只能讓拜克變身成為單車俠去營救風鈴。

神秘老人的家中。拜克醒來發現神秘老人正在擺弄自己的機器人，拜克很緊張。老人說自己只是在修理機器人。兩人交談起來，拜克急於要聯繫博士。神秘老人說，他需要無人機上的通訊設備才能和博士通訊。拜克變身為單車俠，隻身前往無人機。另一邊，研究所內博士和雲翎十分擔心。風鈴醒來，想要給神秘老人拍照，被拒絕。此時三人組來到神秘老人家門口，想要用暴力突破。神秘老人生氣地動用了磁化波，令三人組吃癟逃走。神秘老人幫助單車俠修好通訊裝置后，告訴他們要對自己的資訊保密。後，從神秘老人自言自語中透露：原來就是單車博士的父親趙博士。他現在正致力於找到控制X5能源的方法。

風鈴夢見了自己當選年度最優秀記者，並且對單車俠的真實身份產生了極大的興趣。博士方面，經過這一次事件，博士終於改進了單車俠的通訊能力。而拜克方面則想起了自己在事件中差點暴露自己身份的失誤：風鈴從自己的口氣中聽出了拜克的影子。單車俠把自己的困惑告訴了博士，博士安慰他說不會。風鈴來到了博士公司的研究所，三人組為了從風鈴的口中得到有用的信息，跟蹤風鈴找機會下手。風鈴想得到一些有用的信息，結果博士和拜克一直裝傻，但是風鈴並不好糊弄，一直追問。拜克見勢不妙叫風鈴回家。風鈴一個人出門，三人組伺機而動將風鈴抓走。

單車俠在戰鬥時，接住了風鈴，單車俠一部分變身脫落，拜克的臉露了出來。風鈴似乎發現了單車俠的真實身份。拜克表示回去解釋。三人組再次失敗，首領勃然大怒。拜克向單車博士承認錯誤，說把身份告訴了風鈴。博士對此十分不悅，因為被壞人知道會讓拜克陷入危險。風鈴對自己最好的朋友是單車俠感到十分的激動，同時也答應了不會洩露資訊。雖然風鈴嘴上這麼說，但是卻總是忍不住想要和別人講，每次都被拜克中途打斷才沒有洩露。為此拜克和風鈴發生了爭執。因此風鈴一個人回家，三人組終於抓住了機會，逼迫風鈴說出她知道的信息，風鈴對所有的資訊都守口如瓶。

單車博士得到了一塊藍色的礦石，該礦石會對光起強烈的反應，博士將它叫做迷之石。拜克懷疑石頭和X5有關，博士提議，對發現地鐵道紀念館做細緻的調查。風鈴自告奮勇，要負責調查。反派首領也對藍色礦石產生了興趣，並命令三人組得到它。三人組試圖潛入紀念館，可紀念館警戒森嚴，三人組打算在運輸途中偷襲。拜克和風鈴作為博士的助手，可以任意地出入紀念館。運輸當天三人組進行偷襲，單車俠前往和三人組操控的飛行器展開激戰，爭奪藍色礦石。 三人組得到了礦石，不多做糾纏，直接逃走。此時博士得到了新的消息，新京市的地下發現了大量的礦石。

首領得到了藍色礦石，但是並不能得出結論，他還需要更多的礦石。所以需要三人組去調查剛被發現的同種礦石。博士方面已經完成了對礦石的分析，他判斷這隻是受到X5輻射影響的普通石頭。但為了不讓壞人得到X5的信息，他們決心要守護礦石，並將之前的被搶去的石頭奪回。拜克和風鈴乘坐地鐵趕往目的地。 三人組的飛行器因為山虎的操作失誤和地鐵相撞，地鐵失控。拜克變身單車俠，在三人組的説明下，拜克最終將列車停了下來。三人組因為慣性的原因，從列車上被甩了出去，剛剛到手的藍色礦石掉了一地，三人匆忙之下駕駛飛行器逃走。

首領為了達到自己支配世界的目的，仍然想要得到藍色礦石。博士將拜克和風鈴叫到研究所，三人一起梳理近期發生的事件，他們發現炎天對於X5的興趣似乎過於強烈，而且知道很多本不為人知的秘密，他們開始懷疑炎天的身份。拜克和風鈴走出研究所之後，對於風鈴的安全拜克感到很困擾。就在兩人聊天時，貝比突然出現的貝比挾持了兩人。他想通過這樣的方法威脅博士。博士無奈只能暫時按照他的要求做。而拜克趁他不注意變身成為單車俠。雖然三人組這次拼死戰鬥，但單車俠在博士和研究機械警衛的説明下，還是擊敗了三人組。博士詢問被抓住的三人組，他們的幕後主使。就在此時，反派首領終於現身，並威脅他們交出所有礦石。

原來首領早就覺得三人組沒那麼容易成功，為了保證計劃成功，他就跟了過來。單車俠想要制服首領，但實在巨大的實力差距面前，單車俠不堪一擊。首領輕而易舉地救出來三人，並要去財團奪取礦石。單車俠和風鈴一起追擊首領。博士在同一時間求助了警方。所有人都往財團集結。博士疏散了財團的職員。首領命令三人組去尋找礦石，單車俠和首領在財團展開了苦戰。而風鈴和博士通過特殊的裝備阻止了三人組的前進。首領輕易地和單車俠周旋，並打破了保險庫，取出來裡面的礦石，帶著三人組並從容離去。這次事件使得博士感受到了緊迫感，也讓單車俠明白了自己還不夠強。

單車博士對X5能源的研究進入了新的領域，開始成功稀釋X5能源。而另一方面，首領也急於得到單車博士的研究資料，用以推進自己的實驗進度。他派遣貝比三人組前往博士的住所盜取老博士的研究資料。拜克幫助風鈴練習騎自行車，風鈴屢次摔倒，但還是堅持練習。雲翎從中看出了一些端倪，察覺到或許與英雄計劃有關。貝比三人組想出辦法，入侵了電纜室，希望可以從數據傳輸的角度接入博士的內網電腦，獲取資料。但他們的行動被博士察覺，博士一邊抵禦蘇曼的入侵，一邊通知單車俠前去阻止。單車俠與二寶變身出發，貝比與山虎一同攔住了單車俠，為盜取資料的蘇曼爭取時間。

貝比三人只得到了有限的一點資料，並提交給首領，告知首領單車博士已經開始稀釋X5能源的消息。首領要求他們繼續行動，貝比擔心起首領研究X5能源的用意，但開始說服自己，再次行動。博士研究完成單車女俠的電子智慧開發，風鈴得到了搭檔“叮噹”，成為第二位單車俠。拜克幫助風鈴進行單車俠訓練，但訓練中出現了各種搞笑的狀況。在歡樂的練習過程中，貝比三人組切斷了研究所電源，再次襲來。他們闖進主控制室盜取資料，但遭到了怪盜X的阻攔，單車俠與單車女俠也隨後趕到，三方一場大對抗。

回到平常生活的風鈴，發現同學們對怪盜X的觀感不好，有點不平。 而三人組將盜走的資料交給首領，並報告了單車女俠和怪盜的事情。首領對怪盜X充滿興趣，要求三人組實施，希望可以抓住怪盜。一條關於著名寶石即將展出的消息引爆全城，風鈴判斷怪盜X一定會提前出現，決定前往採訪，拜克卻不以為然。來到展出地點的風鈴卻發現了貝比三人組的蹤跡，向拜克發出警報資訊後，被蘇曼抓住，跟蹤而來的雲翎也著急起來。活動場地的三人組完成了陷阱的設置，博士被炎天調虎離山，雲翎化身的怪盜X果然踏入了陷阱之中。

得救後的風鈴因為沒能阻止怪盜加入邪惡陣營而生自己的氣，瘋狂訓練。三人組發覺首領似乎想要招降怪盜X，心裡不太高興。果然，首領宣佈了怪盜加入組織的消息 ... 頂樓潛入研究所。怪盜X趁三人組不備，發射了信號彈。尚未遠離研究所的風鈴和拜克發現了信號彈，掃描到三人組的入侵行動，變身單車俠，急忙趕回研究所內部。怪盜X解決了研究所的保安系統，蘇曼開始下載資料。單車俠兩人及時趕到，怪盜又暗中幫助他們打敗三人組，減少資料損失，但自己也因此受傷。博士說明怪盜治療，也發現了怪盜的真面目——雲翎。

入侵研究所事件結束，拜克在騎車上學偶遇滑滑板的博德，進行了一場比賽。怪盜X在首領面前責怪三人組拋棄她逃走了，導致三人組挨駡，覺得冤枉的三人組四處尋找怪盜的住處。博士在經歷入侵後決定把英雄計劃提前，於是前往學校物色新人，發現了博德過人的滑板技藝，邀請他來到研究所展示。而首領的秘密基地中，X5能源慢慢的成型，可惜在壓縮的過程中，發生了爆炸。首領與研究員們帶著資料前往其他基地。但秘密基地的大爆炸還是引起了博士的注意，拜克和風鈴變身飛向爆炸處。

單車俠和三人組都離開爆炸現場後不久，博士在現場發現了X5能量氣息，還找到了炎天掉落的一個隨身物品。風鈴和拜克回到研究所，發覺博德可能會成為新的夥伴。首領要求三人組和怪盜合作把自己遺漏的東西偷回來。三人組引開單車俠等人，怪盜進行盜竊，但怪盜已經暗中通報了行動。單車俠和單車女俠一起攔住了三人組，但蘇曼脫離戰鬥，想去搶怪盜的功勞，卻和怪盜一起遇到了新英雄滑板俠。不過新英雄滑板俠不熟悉能力意外失手，首領的隨身物品被怪盜奪走。三人組和怪盜任務完成，離開了研究所範圍，把好消息報告給首領，首領卻要求立即銷毀取回的物品，讓博士的跟蹤計劃落空。

拜克和博德還是有點性格不合，拜克總覺得博德太過招搖。在研究所的博士發現了天丸市出現了一個嚴重的問題，天氣開始不受控制，可能引發各種危機。於是要求拜克與風鈴去影響到天氣控制的舊天氣控制所探查一下原因。首領也發現了這個問題，派出三人組前去了解情況。雙方人馬在舊天氣控制所的廢墟相遇，但他們不知道的是，最後一位英雄輪滑俠羅爾，和這裡淵源很深。拜克遇見三人組後，以為天氣突變與三人組有關係，雙方大打出手。羅爾卻不喜歡爭鬥，沒有加入。

天丸市內的天氣問題越發嚴重，大雨下個不停。博士發現問題沒有改觀，認為不是三人組的緣故，並發現了廢棄隧道內的信號發生源。首領也從三人組那裡得到了關於第四位英雄的消息，更加確定自己必須加快X5能源的研究計劃。拜克、風鈴和博德一起找到羅爾，希望他能加入團隊，但羅爾不太願意。博士此時希望單車俠們前往廢棄隧道尋找信號源，拜克三人只好自己變身出發，到達隧道。隧道内年久失修， 三人小心翼翼地根據博士提供的地圖進行探索，但還是險象環生。博德不慎拉扯牆壁上的管線引起塌方，在隧道頂上思考人生的羅爾被捲入了塌方中。

拜克在學校停車場遇見了羅爾的智慧助手洛洛木，他希望拜克能幫助羅爾鼓起勇氣和信心，加入到與邪惡作鬥爭的事業中，二寶擅做主張幫拜克答應了下來。 既然答應了就要去做，拜克從博士那裡打聽關於羅爾的資訊，並和風鈴一起前往舊天氣控制所附近的廢墟中找到了羅爾，但並沒有打擾他。拜克離開後，羅爾因為貓咪的緣故遭遇山虎，山虎打壞了花壇，激怒羅爾。 原來花壇里的花是羅爾過世的母親留下的。 羅爾變身輪滑俠，與山虎大打出手，山虎速度慢，一身力量無處施展。但山虎的夥伴蘇曼、很快出現，兩盒合擊輪滑俠，輪滑俠不幸落敗。

貝比三人組和單車俠，輪滑俠雙方一場激烈的對抗之後，輪滑俠因為救助闖入戰場的小貓而受傷，令山虎瞭解了自己和輪滑俠發生衝突是一場誤會。輪滑俠受傷之後，單車俠更加獨木難支，兩人只得躲閃撤退，緊急呼叫博德和風鈴的支援。不料博德身體不適，風鈴被怪盜纏住也無法支援，單車俠和輪滑俠只好再次獨自面對三人組。三人組嘲笑單車俠和輪滑俠，單車俠憤而為輪滑俠抱不平。原來舊天氣控制所曾經是輪滑俠父母的工作地，輪滑俠也在這裡長大，一場突如其來的災難毀掉了控制所，輪滑俠的父母也因此遇難，但輪滑俠忘記不了這個充滿了回憶的地方。

對曾經的月光X5事件耿耿於懷的博士，在回顧展覽會中用一座青銅雕塑“團結之拳”參展，告誡大家勿要再犯曾經的錯誤。首領不放過任何可能與X5能源有關的事物，決定派遣三人組再次配合怪盜奪取青銅雕塑。怪盜同樣將這個消息傳遞給了博士，博士吩咐單車俠等四人設下埋伏，羅爾也逐漸融入團隊，大家領命而去。貝比三人組果然露面，並在一瞬間觸發警報，被單車俠等四人堵了個正著。怪盜開啟隱身潛入展廳，但被輪滑俠、滑板俠等發現。貝比三人組攔住小英雄們，但單車女俠還是依靠熱源搜索找出了偷走雕塑的怪盜。

救回了怪盜的貝比三人組沒有找到青銅雕塑，怪盜也陷入昏迷。 蘇曼想要偷偷看怪盜的真面目，但激發了怪盜面具上附著的電磁能沒能成功。怪盜醒來，暗中向博士報告青銅雕塑的真實位置，並向貝比三人組提供了假情報。三人組不知有詐，前往假情報的所在地，卻遇上了同樣前來尋找的單車俠等人。雙方果然為了青銅雕塑的歸屬而大打出手，但單車俠團隊的配合還是不夠默契，滑板俠和單車俠總是自擺烏龍。而貝比三人組也沒有討到好處，他們總是找到事先埋藏的假雕塑，並因此被各種戲耍，怒氣勃發。

博士和怪盜聯繫，決定把兩人暗中商定的計劃提前。而風鈴和拜克已經有點兒懷疑怪盜就是雲翎。怪盜按照計劃向首領報告X5能源可能從博士家轉到研究所的消息，三人組卻懷疑這可能是個陷阱。首領三思之後還是決定嘗試獲取X5能源。單車俠四人聽從博士的吩咐，暫時放下了天氣突變的事件，開始專注保護X5能源轉移。貝比三人組在暗中觀察博士的行動，但博士派出了兩名誘餌研究員，帶著裝有假X5能源的箱子離開，完美調走了山虎和蘇曼。 但三人組中的貝比沒有出現，博士取出另一隻箱子時，貝比突然襲擊，奪走了箱子。

為了保護箱子里的X5能源樣本，首領與單車俠展開了激烈的衝突，而另一方面，滑板俠、單車女俠追逐蘇曼與山虎時收到單車俠的求救信號，急忙返回，二蘇曼因此決定打開箱子，結果發現是假的X5能源樣本，拉著山虎離開。與怪盜X戰鬥中的輪滑俠也接到求救信號，雙方都選擇撤退。單車俠無法單獨戰勝首領，被打得裝甲解體，自己也受了傷，為了救下單車俠，博士只好把箱子交給了首領。等夥伴們趕到的時候，單車俠已經重傷昏倒。貝比三人組和首領匯合，蘇曼向貝比說明瞭自己的發現，放出分身潛入基地，探查首領的計劃，發現首領正在進行極其危險的X5能源使用計劃，決定棄暗投明。

躲藏回百夫長大樓基地的首領全力研究X5能源樣本。雲翎暗中監視百夫長大樓，但一無所獲。單車俠們向博士彙報關於三人組說明自己進攻首領的事，看起來像是和首領鬧翻了。首領正在修復戰鬥受損的零部件，研究人員彙報X5能源研究進入瓶頸的現實，讓首領非常不愉快。失去了工作的三人組開始為以後的生活發愁，但他們還是下定決心先把X5能源取回來還給博士，避免過去慘烈的X5能源爆炸事件再度發生。博士發愁天氣突變和X5能源樣本丟失兩件大事同時發生，拜克的父親秦莫也發愁自己的孩子正在參與危險的事，但拜克說服了他。

輪滑俠與滑板俠聯手對抗首領，博士與怪盜通話，怪盜潛入百夫長大樓，奪回裝有X5能源的菱形裝置。但與此同時，貝比三人組也潛入了百夫長大樓，可惜不幸觸發了警報，被首領發覺。首領脫離戰鬥趕回百夫長大樓，輪滑俠要追，博士勸說不必，並擔憂越加惡化的天氣突變狀況。怪盜X路面與三人組接觸，並找到了暗門，獨自找回了裝有X5能源的菱形裝置。首領趕回大樓，撞見蘇曼、山虎，一言不合，打算清理叛徒。山虎和蘇曼被打得節節敗退，怪盜X現身救出兩人，但也陷入了首領的攻擊中。戰鬥中，菱形裝置掉落，與怪盜產生共鳴，首領急於拿回菱形裝置，結果被怪盜揭穿了炎天的身份。

雲翎的怪盜身份曝光，風鈴心情鬱悶，多虧小夥伴們逗樂，讓她總算放寬了心，還在探望姐姐的過程中，瞭解到姐姐忍辱負重的臥底過程，更加對姐姐愧疚。博士把單車俠等人員分開，各自安排了任務，一方面尋找炎天的下落，一方面還要尋找解決天氣突變問題的方法。羅爾在舊天氣控制中心尋找信號發射源的問題，並發現了山體滑坡的前兆。首領潛伏進三人組的基地，結果被三人組聯合單車俠打跑，不過貝比也不幸淪為人質。蘇曼和山虎決心營救老大，單車俠耶告訴他們自己隨時增援。

拜克與博德等人討論炎天的X5能源計劃，拿炎天做人體融合試驗的想法讓所有人震驚，大家更加急於找到炎天。 他們在百夫長大樓找到了炎天離開時留下的一部分資料，資料提到了多年前的大災難——月之X5事件。警察局長也在博士的請求下，準備人手，搜索炎天的蹤跡。山虎和蘇曼開著圓盤飛行器四處尋找老大貝比的下落。他們在秘密基地附近找到了炎天，偷偷通知了單車俠他們，請求增援。秘密基地中，貝比的人體試驗成功率很低，但炎天堅持實驗。單車俠等人趕到，蘇曼打開了大門，大家在實驗開始時衝進基地，救下來貝比。

單車俠團隊沒有能從人去樓空的百夫長大樓得到其他有用的線索，炎天也沒有再回大樓。博士在警察局長處詢問進展，可惜還是沒有找到。博士讓風鈴和博德繼續監視百夫長集團，天氣繼續惡化，拜克和羅爾去解決就控制室的開關。貝比三人組在貝比獲救後就離開了基地，在暫時棲身的洞穴中，他們中遭遇了一場泥石流，尋找新的藏身之處，蘇曼提供了一個新的想法。炎天逃到森林中的最後一個秘密基地中進行自我修復，X5能源的製作也有了新的進展。拜克和羅爾到達廢棄隧道，再次打開通道，進入其中。

風鈴完成監視任務回到研究所，眾人才發現單車俠已經許久沒有發回聯絡。再加上舊隧道附近發生過山體崩塌，更是讓人擔憂，風鈴和博德緊急前往接應。貝比三人組也來到舊天氣控制所，並打算暫住在舊隧道，結果發現有人已經進入其中。三人決定進去看看，走得小心翼翼。而被困的單車俠二人無法獨自完成任務，幸虧風鈴遇見貝比等人，一起找到了單車俠。但很不穩定的舊隧道再次坍塌，山虎和蘇曼前去找博士報信。炎天自我修復完成，X5計劃也進展順利。單車俠們和貝比一起成功關閉了影響天氣系統的舊系統，並盡棄前嫌共同合作，成功逃離地下。

安全脫險的單車俠眾人解決了天氣異變的問題，回歸研究所，一場合作之後，四俠的配合度和友誼都有所提升。正在所有人都尋找炎天下落的時候，沒人猜到炎天竟然躲藏在貝比三人組的基地里，並冒險將自己作為實驗品，不斷融合未合成完整的X5能源。博士在風鈴從廢墟城市帶回來的資料中發現了神秘老人的信息，決定和單車俠去廢墟找神秘老人。在單車俠的帶領下，博士順利找到了神秘老人，心情激動之餘，也向神秘老人詢問了當年月之X5裝置的事情。廢墟城市的沙塵暴、電磁影響越來越嚴重，博士勸說神秘老人和自己一起離開，但正好遭遇了巨大的沙塵暴，房子垮塌，單車俠用一己之力保護博士等人。

單車俠頂住倒塌的房屋，救下了博士和神秘老人，並帶他們離開了廢墟城市。炎天躲在三傻基地，不斷給自己融合未合成完整的X5能源，並且產生了不良反應導致肌肉膨脹，身體失衡形同怪人。環境的惡化，廢墟城市沙塵暴、地震等頻繁爆發，這些事件引起了神秘老人的注意。關於如何使用X5能源的問題，神秘老人和博士父子倆再次產生爭執。沒有完成版的X5能源，炎天還是無法達到目標。但炎天突然想起了以前竊聽到的，關於怪盜X的晶元和單車俠的動力源的資料，轉而改變計劃，想要抓住兩人，然後提取他們身上的純正x5能源，最終説明自己改善目前的這種怪人的形象，並完成實驗。

受傷而未能成功獲取X5能源的炎天，在三人組基地大發雷霆，意外發現了隱藏在名畫《月光》之中的秘密，發現了一個暗格中的硬碟。硬碟裡儲存有月之X5的重啟控制程式，讓炎天開心不已。拜克從昏迷中醒來，聽說二寶出了大問題，急忙詢問博士。博士修復二寶，但是效果不佳，面對不能重啟的二寶，拜克傷心不已。三人組在離開舊隧道後，躲在了炎天的百夫長大樓，因為貝比說最危險的地方就是最安全的地方。他們無意中在炎天的辦公室電腦里發現了月之X5裝置的藏身之處。並決定把消息傳達給博士等人。他們來到研究所，但不慎與博德產生誤會，雙方大打出手，幸虧有博士及時阻止。

單車女俠和夥伴們在山崖下遭遇落石，但一時間沒有找到月之X5。他們向博士報告，博士很著急，但神秘老人卻覺得，在沒有得到啟動月之X5的控制程式前，並無大礙。他們沒有想到，炎天在月之X5的裝置控制室中把自己找到的控制程式裝了進去，嘗試啟動月之X5裝置，並想用這個當成威脅，讓博士交出X5能源，不然就大肆破壞。拜克臥室中，拜克推著沒有反應的二寶，回憶與它一同度過的點點滴滴，但二寶一直沒醒。博士他們發現，百夫長大廈突然出現絕大的電流流動的現象，連單車俠家中、博士的研究所等地方都受到了影響。博士趕到百夫長集團。

百夫長大廈的充電開啟，已經無法關閉。突然的湧動的電流衝擊了二寶的內部核心，核心因此被啟動啟動，二寶醒來。輪滑俠和滑輪滑俠和滑板俠正視了自己的缺陷，下定決心保護夥伴和城市。三人組為解決月之X5出謀劃策，蘇曼認為可以針對月之X5的啟動程序設計一款對應的病毒程式，只要安裝到月之X5裝置上，就能讓裝置停止運作。單車女俠們覺得辦法可行，但怎麼將病毒程式安裝上去，又成了毛的鈴鐺。炎天因為體內的能量不穩定，痛苦不已，要求博士立即交出X5能源，否則就引爆月之X5裝置。單車女俠與炎天一番交戰，但迫於炎天的威脅，不敢輕舉妄動。

護送X5能源前往炎天處的任務，交到了單車俠的手上，他以拜克的本來面目準備進入月之X5裝置中。博德等人暗中對月之X5裝置進行試探進攻，全然沒有效果。炎天暴虐地叫囂炸毀天丸市，博士無奈，只好讓拜克進入裝置。拜克與炎天虛與委蛇，拖延了時間，蘇曼也抓緊時間製作病毒程式，最終趕在拜克進入裝置前完成，並由山虎暗中交到拜克手上。炎天開啟裝置大門，拜克和隱身中的雲翎、二寶進入了電梯。拜克將病毒程式交給雲翎，自己拖住炎天，果然關閉了月之X5裝置。炎天孤注一擲爆發出體內的未完成版X5能源，打敗了拜克等人的合擊，抓住了博士。