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故事發生在2030年的日本。一種疾病正在全世界範圍內蔓延。疾病感染者會突變成怪物，而且根據年齡、性別、種族的不同，會變化出不同形態。因為變化形態的多種多樣，這種疾病被稱為「Gibia」（像野生鳥獸富有多樣性）。然而，在日本這片廢土之上，一對武士與忍者突然出現了。他們二人從江戶時代的早期穿越而來，在研究疾病治療方法的博士的幫助下，共同展開行動。面對著接踵襲來的Gibia，搶奪路人食糧的亡命之徒，以及各種敵人的圍攻之下，殺機重重、生死攸關的冒險之旅開始了。

第1話【神隱】，2030年東京，人類被GIBIA化。面對世界範圍內開始的GIBIA化，凱琳向星辰許願“請賜我力量”如同回應她的許願，千水．兼六從過去前來。第一次與GIBIA對峙的千水．兼六等人陷入苦戰…就在這時，凱瑟琳前來相助。千水．兼六前往凱瑟琳他們居住的營地，然而…

第2話【漩渦的前方】，在營地，為了探出千水的實力，凱瑟琳向千水發出挑戰。前田為千水帶來了刀，就在這時，燈光突然熄滅。GIBIA逐漸靠近。千水．兼六等人，要如何與未知的GIBIA戰鬥？而從過去而來的千水．兼六，會如何與GIBIA戰鬥？

第3話【第三個男人】，在營地結束戰鬥，凱瑟琳一行人出發尋找物資。一行人得知新瀉有一家GIBIA研究所。雪之丞從過去來到現在，凱瑟琳一行人遭遇從未見過的GIBIA，那GIBIA究竟是?

第4話【危險地帶】，擊退邁泰奧拉，凱瑟琳一行人度過一夜。眾人因GIBIA化的布萊昂之死悲痛不已。千水．兼六．雪之丞在經過的一家購物中心找到自己的武器。此時出現大量GIBIA，唯有應戰……欲前往新瀉的凱瑟琳一行人遭遇新的問題……！

第5話【惡 對 武士道】，以亞當的死換來劫後餘生的凱薩琳一行人。前往GIBIA研究所的路上，遭遇名為加利安斯的組織襲擊。千水與其對峙。他們的目的究竟是！？敵人不只有GIBIA，和人類之間的戰鬥也就此開始。

第6話【走投無路】，前往新瀉的途中，凱瑟琳一行人在隧道裡遭遇GIBIA襲擊。被GIBIA襲擊的凱瑟琳的過去被揭開。凱瑟琳面臨危機之時，警察彩芽登場，她究竟是夥伴，還是敵人！？

第7話【通向死亡的夢中路】，彩愛加入隊伍，凱瑟琳一行人重新向GIBIA研究所出發。在那裡，邁泰奧拉．加利安斯再度登場。凱瑟琳被敵人重重包圍。面對邁泰奧拉陷入苦戰的千水．兼六．雪之丞……他們究竟如何才能擺脫危機！？

第8話【告別的信】，尤莉卡因一時大意被GIBIA中傷。她因擔心自己被GIBIA化而離開了大家……兼六．彩愛前往藥鋪尋找尤莉卡。凱瑟琳．雪之丞處也遭遇大量GIBIA入侵。看著疲勞困頓無法戰鬥的千水，雪之丞拿出了拼死的覺悟……

第9話【直至燃燒殆盡】，兼六．彩愛歸來，雪之丞．尤莉卡卻犧牲了。凱瑟琳一行為雪之丞．尤莉卡的死悲痛不已。離開的加利安斯成員前往修理汽車，卻遭遇GIBIA襲擊。於是，和兼六的過去聯繫起來。千水．兼六看到了赤紅的月亮……

第10話【新的夥伴】，凱瑟琳一行人到達GIBIA研究所。在那裡遭遇大量GIBIA，加利安斯又從後方追來。他們的目的是……！？彩愛．鳩波達成和解，凱瑟琳一行人和加利安斯在夜宴中加深關係，達成合作。然而，其中的吉永卻……

第11話【虛無的愛】，一行人度過了快樂的一夜，卻再次遭遇邁泰奧拉來襲。邁泰奧拉的秘密，吉永的過去和目的，GIBIA是從哪裡，如何出現。故事從這裡才剛開始。吉永博士突然變臉，將彩愛GIBIA化。

第12話【在生命的盡頭】，一行人與吉永博士陷入苦戰……大量GIBIA來襲。在鳩波拼死的覺悟下終於打倒敵人，被打倒的加利安斯．紅蓮，被留下的凱瑟琳等人為了逃生前往海邊。面臨絕地危機，最終究竟會如何！？