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第1話【獸之巨人】，結束與女巨人的對戰後，人們發現牆裡的巨人，為問出巨人的真面目，韓吉厲聲逼問尼克司祭，但尼克抵死不從地三緘其口，而這一切要回溯到12小時前，正在羅塞之牆南區待命的柯尼等104期生，得知有眾多巨人來襲的消息，而且巨人全數往柯尼的故鄉前進，為讓柯尼等人前去協助居民與村莊避難，米凱分隊長採取了某個行動……。

第2話【我回來了】，巨人出現五小時後，往北走的莎夏終於來到故鄉，腦裡閃過的是當時和父親之間的苦澀回憶……，睽違三年後見到的故鄉，早已無法讓人類居住，後來發現了新的村莊，卻目睹悽慘光景。另一方面，艾連等人急著趕往羅塞之牆，但不知何故尼克司祭也在一行人中，他表示要親眼確認過狀況後，再決定是否公開城牆派掌握的秘密。

第3話【往西南】，柯尼的故鄉完全不見人影，只有一隻仰躺在殘簷破壁屋子裡的巨人，而且似乎對柯尼說了一句話……。同一時候，里柯率領的駐紮兵團第一師團精銳部隊，正在東邊防線上與巨人交戰，漢尼斯也率領羅塞之牆對策部隊沿著城牆偵查道路，卻完全不見巨人蹤影，兩邊部隊都感到不對勁，而巨人出現後的第一夜即將來臨。

第4話【士兵】，柯尼和萊納、貝爾托特所屬的南班，與克里斯塔和尤米爾所屬的西班在暗夜中會合，決定在厄特加爾城遺址裡度過一夜，沒想到在負責監視的人員察覺到時，城堡四周已經被許多巨人包圍。身上沒有戰鬥裝備的104期生們只能躲到塔裡避難，但顯然遲早會被巨人攻破。孤軍奮鬥抵抗巨人的萊納，腦中突然閃過昔日的記憶……？

第5話【希絲特莉亞】，在艾連等人還隸屬訓練兵團時，某次在雪山訓練結束後，大家發現克里斯塔和尤米爾不見蹤影，原來是克里斯塔陪在訓練中突然身體不適的達茲身邊，尤米爾也為了陪她而同時迷路。在暴風雪中天色漸暗，克里斯塔拖著奄奄一息的達茲朝向山腳下前進，但情況愈來愈險峻，3人有可能無法獲救，此時克里斯塔做出了決斷……。

第6話【戰士】，原本包圍厄特加爾城的巨人，在尤米爾和及時趕到的調查兵團主力部隊活躍下，終於全數擊潰。受重傷的尤米爾被運往托洛斯特區接受治療，其餘的調查兵團決定重新展開修復作戰，但原本應該來告知洞口位置的漢尼斯卻表示「完全找不到洞口」，那麼究竟巨人是如何進到牆內？艾連一行人只能狐疑地留在托洛斯特區待命……。

第7話【打‧投‧極】，盔甲巨人和超大型巨人在艾連眼前現身，憤怒的艾連也立刻化身為巨人，一拳揮向盔甲巨人。另一方面，超大型巨人開始破壞調查兵團正在待命的城牆，並將昏睡中的尤米爾吞進嘴裡，調查兵團因此在韓吉的命令下一起攻擊超大型巨人，但巨人全身噴出熱氣讓人無法靠近，而艾連也與盔甲巨人陷入苦戰……。

第8話【追擊者】，艾連巨人只差一步就能打倒盔甲巨人，卻因超大型巨人的頭部掉落而逆轉情勢，艾連也被盔甲巨人擄走，又因為超大型巨人產生的熱氣和風壓，讓現場士兵們受到重創，等米卡莎恢復意識時，艾連早已被帶走超過五小時，讓米卡莎忍不住悲傷落淚，漢尼斯見狀決定替阿爾敏和米卡莎打氣……。

第9話【開口】，敗給盔甲巨人的艾連在巨樹森林裡醒來後，得知眼前竟是同樣擁有巨人化能力的人。身陷巨人巢穴的森林裡，即使能化為巨人，也很難順利脫逃，加上先前才剛奮戰過，艾連已無體力再度巨人化，只能靜待巨人不動的夜晚來臨，但此時某人卻開始說服艾連「跟我們回故鄉去」……。

第10話【孩子們】，離日落只剩一小時，調查兵團菁英們終於趕到巨樹森林，儘管目的是要救回艾連而非戰鬥，依舊是充滿危險的作戰。在此同時，一心想救克里斯塔的尤米爾開始焦急，並回想起年幼時的貧民窟生活和後來的多舛命運，以及與克里斯塔的相遇……究竟尤米爾會採取什麼行動！？

第11話【突擊】，盔甲巨人現身在決定往森林挺進的艾爾文面前，肩膀上還有某個人物揹著艾連佇足，雖然調查兵團奮力想救回艾連，米卡莎也試圖攻擊盔甲巨人與該名協助者，卻數度被另一隻巨人阻撓，讓米卡莎全面露出敵意欲殺了巨人，但此時有個人物出面呼籲停止戰爭，究竟這名人物是……！？

第12話【怒吼】，艾爾文引來的巨人大軍一齊攻向盔甲巨人，在猶如地獄的悲慘景況下，調查兵團總算成功奪回艾連，但盔甲巨人卻開始將巨人紛紛丟向正在撤退的士兵們，導致艾連和米卡莎摔落馬，眼前還出現了五年前吃下艾連母親‧卡露拉的巨人，艾連決定化為巨人，親手討伐敵人以報這份血海之仇……。