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第1話【我開始"神懸"了】，皇纏是在好友草薙由麻家中所經營的神社做巫女兼職的普通國中生，雖然日子過得平淡而平凡無奇，但對她來說這正是無可取代的寶貴時光。然而父親伸吾正在進行調查的案件，卻意外地改變了她的命運…。

第2話【神明纏上身】，在纏意外的變身後的活躍下，天萬神社內的騷動就此告一段落。然而不知所措的纏回到了家中，卻發現自己被奇怪的神明給纏上了身。在由麻的建議下，意外獲得了退魔之力的纏即將以退魔少女的身分展開退魔活動？！

第3話【神明裝作不知情】，銀行強盜堅守事件平安落幕，而退魔少女的知名度也隨著網路流傳快速水漲船高。正當纏對退魔少女的身分以及與父親伸吾之間相處的問題感到煩惱時，前些日子出現在天萬神社的露西耶拉突然再度來到神社，並且表示要擔任纏與由麻的家庭教師…

第4話【她的覺悟與我的理由】，克拉莉絲回想起三年前的往事。克拉莉絲因為負責教導新人芙蘿絲‧歐利恩斯而與她結為搭擋。相對於一心執著於消滅奈茲的克拉莉絲，芙蘿絲則深信人類與奈茲一定能夠找出戰鬥之外的相處之道。然而她的這個信念卻招來了無可挽回的悲劇…。

第5話【特別的普通】，在纏的協助下成功擊敗的宿敵「教義殺手」的克拉莉絲繼續執行監視及保護纏的工作。希望克拉莉絲能夠像個普通女孩生活的纏，有一天決定帶克拉莉絲來到東京購物，而做為回報，同行的由麻向克拉莉絲提出了一項請求…。

第6話【對不起】，狐狸「空」與狸貓「海」，兩個成對的高次元體成為了由麻的神明，於是由麻也正式成為了退魔少女，興致勃勃的由麻立刻展開了退魔行動，然而在一片天下太平下根本就沒有與惡靈有關的委託。正當由麻因為沒有惡靈事件而感到沮喪時，突然收到了釜谷商店街出現了「幽靈」的情報…

第7話【海與溫泉偶惡靈】，轉眼間進入了暑假。在露希耶拉的策劃下，纏等人一同來到位在海邊的天海神社旅行。傍晚，天海神社的巫女雨音彌生前來迎接一行人入住，同時纏也因此得知自己的母親栞過去曾經在天海神社擔任巫女的過去…。

第8話【小小的願望】，在彌生的活躍下，終於成功將奈茲擊敗，然而在戰鬥過後彌生也因為體力用盡而昏倒。在彌生休養的期間，纏從伸吾的口中得知了兩人相遇的經過，並且再次了解到自己希望能與父母共度普通生活的願望。這個時候，一對新的奈茲出現在露西耶拉面前…。

第9話【謝謝】，奈茲的襲擊造成的衰弱事件數量在釜谷市逐漸增多，而纏進行纏創進行退魔行動的次數也隨之增加，每解除纏創就會失去一套衣服的纏快沒衣服可穿了！在自由市集採購完衣服後的纏與伸吾來到了瞭望台，然而卻遭遇到奈茲的襲擊，並且被結界困在瞭望台之中…。

第10話【被開啟的門】，24個次元的頂點「頂次元」的次元穴出現在釜谷市上空。在由麻的祖父清玄的說明下，纏得知了當頂次元的次元穴開啟的結果，以及母親栞十年前做為纏創巫女的過去，而如今纏也將面對相同的命運，儘管充滿了迷網，纏最後還是下定了決心。另一方面為了替同伴復仇，奈茲魯道斯來到了天萬神社…。

第11話【我要走了】，從彌生口中得知了十年前栞動身前往頂次元的真相後的纏下定了決心。為了取回平凡無奇但無可取代的與父母共度的時光，纏終於不再迷網，決定也要前往頂次元帶在頂次元奮戰的母親回到家人身邊…。

第12話【普通才是最棒的】，在前往頂次元的路上，原本以為已經被消滅的奈茲「教義殺手」費戈爾竟然現身阻擋了纏等人的去路，克拉莉絲決定留下來與費戈爾做最後的了斷。隨著克拉莉絲誠實面對自己的情感，戰況產生了驚人的變化…？另一方面，在兩人的協助下纏終於到達了頂次元。母親栞就在頂次元之門的另一側…纏這時再度許下了願望，一個最平凡無奇、但對她來說比任何一切都還要重要的心願。